10 ANHANG
10.1 Zusammenstellung der insgesamt erhaltenen BAC-Klone aus dem mehrfachen Screening
10.1.2 Auflistung der positiven BAC-Klone aus den Framework-Gen- Screening-Runden
Tabelle 16: BAC-Klone aus dem BAT1-Screening. Angegeben sind alle BAT1-positiven BAC-Klone mit ihren Koordinaten, die auch gleichzeitig deren Bezeichnung darstellen. Weiterhin ist die Filter-Nr. sowie ein Vermerk, ob der jeweilige Klon beim BACPAC-Resources Center bestellt wurde angegeben.
BAC-Klon-Koordinaten (Bezeichnung BAC-Klon)
Filter-Nr. Bestellung beim BACPAC Resources Center
24 556H07 12 ja
Tabelle 17: Klone aus dem TCF19-Screening. Angegeben sind alle TCF19-positiven BAC-Klone mit ihren Koordinaten, die auch gleichzeitig deren Bezeichnung darstellen. Weiterhin sind die Filter-Nr. sowie ein Vermerk, ob der jeweilige BAC-Klon beim BACPAC-Resources Center bestellt wurde angegeben.
BAC-Klon-Koordinaten (Bezeichnung BAC-Klon)
Filter-Nr. Bestellung beim BACPAC Resources Center
1 42E05 01 nein
2 36G21 01 nein
3 42D05 01 nein
4 97J24 03 ja
5 191K16 03 ja
6 140J01 03 nein
7 286B23 06 nein
8 394P03 09 ja
9 456N07 10 1
10 508I05 11 nein
11 487C11 11 ja
12 508I05 11 nein
13 570O05 12 ja
14 575D18 12 ja
15 556H07 12 ja
Tabelle 18: Klone aus dem CAT56-Screening. Angegeben sind alle CAT56-positiven BAC-Klone mit ihren Koordinaten, die auch gleichzeitig deren Bezeichnung darstellen. Weiterhin sind die Filter-Nr. sowie ein Vermerk, ob der jeweilige BAC-Klon beim BACPAC-Resources Center bestellt wurde angegeben.
BAC-Klon-Koordinaten (Bezeichnung BAC-Klon)
Filter-Nr. Bestellung beim BACPAC Resources Center
Tabelle 19: BAC-Klone aus dem TRIM39-Screening. Angegeben sind alle TRIM39-positiven BAC-Klone mit ihren Koordinaten, die auch gleichzeitig deren Bezeichnung darstellen. Weiterhin sind die Filter-Nr. sowie ein Vermerk, ob der jeweilige BAC-Klon beim BACPAC-Resources Center bestellt wurde angegeben.
BAC-Klon-Koordinaten (Bezeichnung BAC-Klon)
Filter-Nr. Bestellung beim BACPAC Resources Center
1 25O10 01 nein
2 22J05 01 nein
3 44N18 01 nein
4 44P11 01 ja
5 88H06 02 ja
6 94B22 02 ja
7 57K24 01 nein
8 128J05 03 nein
9 127O01 03 nein
10 133E18 03 nein
11 121A02 03 nein
12 104C06 03 nein
13 98C19 03 nein
14 153G20 04 ja
15 172B19 04 nein
16 222J06 05 nein
17 236E22 05 nein
18 240H13 05 ja
19 193N14 05 nein
20 255J10 06 nein
21 336I16 07 ja
22 323J17 07 ja
23 336G23 07 ja
24 373F12 08 nein
25 422G15 09 ja
Tabelle 20: BAC-Klone aus dem TRIM26-Screening. Angegeben sind alle TRIM26-positiven BAC-Klone mit ihren Koordinaten, die auch gleichzeitig deren Bezeichnung darstellen. Weiterhin sind die Filter-Nr. sowie ein Vermerk, ob der jeweilige BAC-Klon beim BACPAC-Resources Center bestellt wurde angegeben.
BAC-Klon-Koordinaten (Bezeichnung BAC-Klon)
Filter-Nr. Bestellung beim BACPAC Resources Center
Tabelle 21: BAC-Klone aus dem PPP1R11-Screening. Angegeben sind alle PPP1R11-positiven BAC-Klone mit ihren Koordinaten, die auch gleichzeitig deren Bezeichnung darstellen. Weiterhin sind die Filter-Nr. sowie ein Vermerk, ob der jeweilige BAC-Klon beim BACPAC-Resources Center bestellt wurde angegeben.
BAC-Klon-Koordinaten (Bezeichnung BAC-Klon)
Filter-Nr. Bestellung beim BACPAC Resources Center
26 508I05 11 nein
27 552A12 12 nein
28 576J18 12 nein
29 558C07 12 nein
Tabelle 22: BAC-Klone aus dem MOG-Screening. Angegeben sind alle MOG-positiven BAC-Klone mit ihren Koordinaten, die auch gleichzeitig deren Bezeichnung darstellen. Weiterhin sind die Filter-Nr. sowie ein Vermerk, ob der jeweilige BAC-Klon beim BACPAC-Resources Center bestellt wurde angegeben.
BAC-Klon-Koordinaten (Bezeichnung BAC-Klon)
Filter-Nr. Bestellung beim BACPAC Resources Center
Tabelle 23: BAC-Klone aus dem SACM2L-Screening. Angegeben sind alle SACM2L-positiven BAC-Klone mit ihren Koordinaten, die auch gleichzeitig deren Bezeichnung darstellen. Weiterhin sind die Filter-Nr. sowie ein Vermerk, ob der jeweilige BAC-Klon beim BACPAC-Resources Center bestellt wurde angegeben.
BAC-Klon-Koordinaten (Bezeichnung BAC-Klon)
Filter-Nr. Bestellung beim BACPAC Resources Center
Tabelle 24: Klone aus dem RING1-Screening. Angegeben sind alle RING1-positiven BAC-Klone mit ihren Koordinaten, die auch gleichzeitig deren Bezeichnung darstellen. Weiterhin sind die Filter-Nr. sowie ein Vermerk, ob der jeweilige BAC-Klon beim BACPAC-Resources Center bestellt wurde angegeben.
BAC-Klon-Koordinaten (Bezeichnung BAC-Klon)
Filter-Nr. Bestellung beim BACPAC
Resources Center
1 157M09 04 ja
2 150A06 04 Nein
3 345C07 08 nein
4 356A23 08 nein
5 534I09 12 ja
Göttingen, den 24.02.2005 Eidesstattliche Erklärung
Hiermit erkläre ich, dass ich die Dissertation mit dem Titel „Genomische und evolutionäre Analyse von MHC-Klasse-I-Genen bei einem Halbaffen (Microcebus murinus)“selbständig verfasst habe.
Bei der Anfertigung wurden folgende Hilfen Dritter in Anspruch genommen:
Die methodischen Einweisungen durch die wissenschaftlichen Mitarbeiter sowie technische Assistentinnen und Assistenten der Abteilung Primatengenetik des Deutschen
Primatenzentrums und dem Institut Immungenetik der Georg-August-Universität Göttingen.
Die verwendeten Primer wurden von der Abteilung Primatengenetik des Deutschen Primatenzentrums sowie vom Institut Immungenetik der Georg-August-Universität Göttingen zur Verfügung gestellt.
Die Sequenzierung des BAC-Klones wurde durch Herrn Dr. Takashi Shiina (Tokai University School of Medicine Isehara, Japan) durchgeführt.
Die verwendete BAC-Bank „CHORI-257“ wurde vom BACPAC Resources Center (www.bacpac.chori.org) bezogen.
Ich habe keine entgeltliche Hilfe von Vermittlungs-, bzw. Beratungsdiensten (Promotionsberater oder andere Personen) in Anspruch genommen. Niemand hat von mir unmittelbar oder mittelbar entgeltliche Leistungen für die Arbeit erhalten, die im Zusammenhang mit dem Inhalt der vorgelegten Dissertation stehen.
Ich habe die Dissertation in den Abteilungen Primatengenetik und Infektionspathologie des
Deutschen Primatenzentrums Göttingen sowie im Institut Immungenetik der Universität Göttingen unter der Leitung von Herrn Dr. L. Walter, Herrn Univ.-Prof. E. Günther und Herrn Univ.-Prof. F.-J. Kaup angefertigt.
Die Dissertation wurde bisher nicht für eine Prüfung oder Promotion oder für einen ähnlichen Zweck zur Beurteilung eingereicht.
Ein Posterbeitrag sowie ein Abstract erfolgten im Rahmen des Joint Annual Meeting of the German and Dutch Societies for Immunology im Oktober 2004.
NEFF, J., T. SHIINA, H. INOKO, E. GÜNTHER u. L. WALTER (2004):
Genomic and evolutionary analysis of the MHC class I region in a prosimian primate species, the gray mouse lemur (Microcebus murinus).
Immunobiology 209, 409
Ich versichere, dass ich die vorstehenden Angaben nach bestem Wissen vollständig und der Wahrheit entsprechend gemacht habe.
Jennifer Neff
Mein besonderer Dank gilt Herrn Prof. Dr. Eberhard Günther für die Überlassung dieses interessanten Themas und die Möglichkeit in der Abteilung für Immungenetik der Universität Göttingen einen großen Teil dieser Arbeit durchführen zu dürfen. Auch möchte ich mich für die intensive Betreuung, die Unterstützung bei der Anfertigung der Arbeit und dem jederzeit gewährten Rat bedanken.
Zu meinem Bedauern verstarb Herr Prof. Günther vor der Einreichung der Arbeit.
Herrn Dr. Lutz Walter gilt mein großer Dank für die wissenschaftliche Anleitung bei der Durchführung der Versuche, die stetige Bereitschaft zu zahlreichen Diskussionen sowie der Abfassung dieser Dissertation. Besonders die Betreuung nach dem Tod von Herrn Prof. Dr.
Günther möchte ich an dieser Stelle hervorheben, die den Abschluss der Arbeit ermöglichte.
Herrn Prof. Dr. Franz-Josef Kaup danke ich für die Übernahme der Betreuung und für die Unterstützung bei der Anfertigung dieser Arbeit.
Herrn Dr. Ralf Dressel danke ich für die gewährte freundliche Betreuung und Unterstützung bei der Anfertigung sowie für die Ratschläge bei der Korrektur dieser Arbeit.
Des Weiteren danke ich Herrn Dr. Christian Roos für die freundliche, kollegiale
Zusammenarbeit und für die Zeit, die er sich bei der Klärung von Problemen während der Durchführung der Versuche sowie bei der Durchsicht der Arbeit genommen hat.
Herrn Dr. Takashi Shiina (Tokai Universität School of Medicine Isehara, Japan) danke ich für die gute Zusammenarbeit.
Bei Frau Leslie Elsner möchte ich mich für die immer gewährte Hilfsbereitschaft und Unterstützung bedanken, die zum Gelingen dieser Arbeit beigetragen haben.
Frau Petra Kiesel danke ich für ihre geduldige Art bei der Einweisung in die verschiedenen Methoden sowie für ihre ständige Hilfsbereitschaft während der letzten zwei Jahre.
Ich danke Frau Christiane Schwarz für ihre Ratschläge und Hilfestellungen, die liebevolle Umsorgung der Doktoranden sowie für die vielen schönen Stunden außerhalb des
Laboralltages.
Ein herzliches Dankeschön an alle weiteren Mitarbeiter, Doktorandinnen und Diplomanden der Abteilung Primatengenetik für das nette Arbeitsklima, ihre Hilfsbereitschaft und für die vielen lustigen Momente im Doktorandenzimmer.
Ich möchte mich bei der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG) für die finanzielle Unterstützung in Form eines Stipendiums im Rahmen des Graduiertenkollegs „ Perspektiven der Primatologie“ bedanken.
Mein herzlicher Dank gilt Fr. Dr. Renate Lorenz, die mir bereits während des Studiums ermöglichte, einen Einblick in den Praxisalltag zu bekommen und mir bis heute viele lehrreiche Tipps vermittelt.
Kindheitstraum, Tierärztin zu werden, nicht in die Tat umgesetzt und nicht bis heute zahlreiche interessante Stunden in ihrer Praxis verbracht.
Weiterhin möchte ich meiner Freundin Melanie Eisenhauer-Janson für ihre jahrelange Freundschaft und für die Durchsicht meiner Arbeit danken.
Ich danke Birgit und Sven Willun von ganzem Herzen, dass sie mir stets zur Seite stehen, mir immer wieder Mut machen und ständig an mich glauben.
Meiner Freundin Sabine Reinhold möchte ich für die schöne gemeinsame Zeit während des Studiums in Berlin danken, aber v.a. dass sie mir im letzten Staatsexamen in jeder Stunde zur Seite gestanden hat.
Ganz herzlich möchte ich mich bei allen nicht namentlich aufgeführten Personen, die mich in den letzten Jahren begleitet haben, für die anspornenden sowie aufmunternden Worten bedanken und dass sie so oft Verständnis für meinen Zeitmangel haben mussten.
Mein herzlichster Dank geht jedoch an meine Eltern, meine Schwester und meine Großmutter. Ohne sie wäre die Ausbildung zur Tierärztin und die Abfassung dieser Dissertation nicht möglich gewesen. Es war die richtige Entscheidung, noch einmal einen neuen Berufsweg einzuschlagen und ich danke Euch für Eure Liebe, Eure moralische sowie auch finanzielle Unterstützung.
Schließlich danke ich meinen verstorbenen Großeltern, Hildegard und Ernst Heinze, für ihre Liebe und dass sie mich indirekt auf den Hund gebracht haben sowie meinem verstorbenen Großvater Wolfgang Neff, dass er bis zum Beginn dieser Arbeit immer für mich da war.
Leider können sie diesen Tag nicht mehr miterleben.
240H13
Die Abfolge der Gene ist bisher nicht eindeutig geklärt MHC-Klasse-I-hybridisierendes
MIC-hybridisierendes Fragment Framework-Gen
Fragment
MHC-Klasse-I-Fragmenten, den MIC-Fragmenten sowie den Framework-Genen.
Synopse der etablierten Contigs der MHC-Region des Microcebus murinus.
Dargestellt sind die einzelnen Contigs (siehe Kap. 5.5, Abb. 14, 22, 29, 31) mit den dazugehörigen
175C24
12,0 kb 8,7 kb
TRIM26
MHC-Klasse-I-Fragmente
8,5 kb 7,4 kb
6,0 kb 5,0 kb
18,0 kb 5,5 kb
5,6 kb