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Chemikalien, Enzyme und Verbrauchsmaterialien

2.1.1 Chemikalien

Aceton Merck, Darmstadt

Acrylamid/Bisacryl Rotiphorese Gel 30 Roth, Karlsruhe

Ammoniumpersulfat (APS) Biorad, München

Aquamount BDH, England

Borsäure/Borat Merck, Darmstadt

Bovine Serum Albumin (BSA) Sigma, München

Bromphenolblau Merck, Darmstadt

Buthanol Merck, Darmstadt

Coomassie brilliant blue R250 Serva, Heidelberg

Dimethylsulfoxid (DMSO) Serva, Heidelberg

Dodecysulfat-Natriumsalz (SDS) Sigma, München

Dithiothreiol (DTT) Sigma, München

E 64 (trans-Epoxysuccinyl-L-leucyl-Amino-(4-guanidinio)-butane) Sigma, München

EDTA Sigma, München

Essigsäure (99,8%) Riedel de Haen AG, Seelze

Ethanol p.a., absolut Riedel de Haen AG, Seelze

Formaldehyd (37%) Merck, Darmstadt

G50 Push-Columns Stratagen, Heidelberg

Glycerin Merck, Darmstadt

Gluthation-Sepharose-4B-Affinitätssäulen Pharmacia, Uppsala/Schweden

Hämatoxylin Vector, Petersborough/UK

Hi-Trap-Säulen Pharmacia, Uppsala/Schweden

Isopropyl-β-D-thiogalactosid (IPTG) Roth, Karsruhe

Isopropanol Merck, Darmstadt

Lipofectamin Gibco BRL, Eggenstein

Magermilchpulver Difco, Augsburg

Magnesiumchlorid Merck, Darmstadt

Maxi-Präp Präparations-Kit Qiagen, Hilden

Mecaptoethanol Merck, Darmstadt

Mineralöl Sigma, München

Mini-Präp Präparations-Kit Qiagen, Hilden

Natriumacetat Merck, Darmstadt

Natriumchlorid Merck, Darstadt

Natriumcitrat Merck, Darmstadt

Natriumdesoxycholat Merck, Darmstadt

Natriumdodedyl (SDS) Sigma, München

Natriumhydroxyd Plätzchen Merck, Darmstadt

NP-40 Sigma, München

Phenylmethylsulfonylfluorid (PMSF) Boehringer Mannheim

Pikrinsäure Merck, Darmstadt

Protein-Assay nach Bradford, Bio-Rad Biorad, München

Protein-Assay nach Lowry, DC-Protein Assay Biorad, München

ProteinaseK Boehringer Mannheim

Rainbow protein weight marker (14-200 kD) Amersham, Braunschweig

RNaseA Boehringer Mannheim

RNazol B, RNA Extraktionslösung CINNA/BIOTECX

RNA PolyA Extraktionssäulen Qiagen, Hilden

Salzsäure konzentriert Merck, Darmstadt

Sephadex G25 Sigma, München

N, N, N`, N`-Tetramethyl-Ethylendiamin (TEMED) Promega, Heidelberg

Tris-Base Sigma, München

Triton X 100 Merck, Darmstadt

Tween 20 Sigma, München

Xylen-Cyanol Sigma, München

2.1.2 Nukleinsäuren, Nukleotide, Vektoren, Enzyme, Material für RT-PCR pEX-2T-Expressionsvektor Promega, Heidelberg

pGEX-GST-Axl

1kb DNA Leiter Gibco BRL, Eggenstein

2`Deoxynukleosid 5`Triphosphat Boehringer Mannheim

5`γ-33P-dCTP DuPont/NEN, Boston

5`α-33P-dCTP DuPont/NEN, Boston

Oligo dT (p12-p18) Gibco BRL, Eggenstein Reverse Transkriptase (Superscript) Gibco BRL, Eggenstein

RNase Inhibitor Boehringer Mannheim

Taq Polymerase Boehringer Mannheim/Eurogentec

T4Poly Nuceotid Kinase Gibco BRL, Eggenstein

1kb Ladder Gibco BRL, Eggenstein

Autoradiographiekassetten Kodak, Stuttgat Röntgenfilme, Kodak X-OMAT, Kodak Kodak, Stuttgart PCR-Geräte Robocycler Gradient 40 Stratagene, Heidelberg Filmentwicklungsgerät Curix 60 Agfa, Leverkusen Acrylamid-Gelapparaturen Horizontal von Keutz, Reiskirchen

Geltrockner Biorad, München

2.1.3 Primer/Oligonukleotide

GAPDH 5` 5` CGT CTT CAC CAC CAT GGA GA 3`

GAPDH 3` 5` CGG CCA TCA CGC CAC AGT TT 3

CD44std 5` 5` CAG CAA CCC TAC TGA TGA CG 3`

CD44std 3` 5` GCC AAG AGG GAT GCC AAG ATG A 3`

CD44 v2 (mit CD44std 5`) 5` AAG ATG ATT CTT TGA CTC TGA TGG 3`

CD44 v3 (mit CD44std 5`) 5` GTG CTG GAG ATA AAA TCT TCA 3`

CD44 v4 (mit CD44std 5`) 5` CAG TCA TCC TTG TGG TTG TCT G 3`

CD44 v5 (mit CD44std 5`) 5` TGA TGC TCA TGG TGA ATG AGG 3`

CD44 v6 (mit CD44std 5`) 5` CTG TCC CTG TTG TCG AAT GG 3`

CD44 v7 (mit CD44std 5`) 5` GGT GTG AGA TTG GGT TGA AG 3`

CD44 v8 (mit CD44std 3`) 5` ATG GAC TCC AGT CAT AGT ACA ACG 3`

CD44 v9 (mit CD44std 3`) 5` GAG CTT CTC TAC ATC ACA TGA AGG 3`

CD44 v10 (mit CD44std 3`) 5` ATA GGA ATG ATG TCA CAG GTG G 3`

CD44 exon15 (mit CD44std 3`) 5` GAG ACC AAG ACA CAT TCC ACC 3`

CD44 TM (mit Oligo dT) 5`AGT TTG CAT TGC AGT CAA CAG TCG 3`

PJA 2 (Axl C-terminal) 5` GGT GGC TGT GAA GAC GAT GA 3`

PJA 3 (Axl C-terminal) 5` CTC AGA TAC TCC ATG CCA 3`

PJA 11 (Axl N-terminal) 5` TGA GCT TGG CAG CTC AGG TT 3`

PJA 12 (Axl N-terminal) 5` GCA GGC TGA AGA AAG TCC CT 3`

c Mer 3F 5` CAC CTC TGC CTT ACC ACA TCT 3`

cMer 2R 5`ATC CAC AAA AGC AGC CAA AGA 3`

Tyro3 5` 5` CAC TGA GCT GGC TGA CTA AGC CCC 3`

Tyro3 3` 5` AAT GCA TGC ACT TAA GCA GCA GGG 3`

Ron 5` 5` CGG CCC CGG CCA CTC TCA GAG CC 3`

Ron 3` 5` GGG TCA GTG TTG GTG TGG TCA CTG C 3`

Protein S 5` 5` GCC TGG TTA CTG TGG AGA AGG GC 3`

Protein S 3` 5` CGG CAA GTT GTC TTT GAA GGT C 3`

Met 5` 5` CAA AAC AGG TGC AAA GCT GCC AGT G 3`

Met 3` 5` GAG AAG GAT ACG GAG CGA CAC 3`

Ret p5 5` AGG GAT AGG GCC TGG GCT TC 3`

Ret p3 5` TAA CCT CCA CCC CAA GAG AG 3`

gas 6-1 5` CAA TCT CTG TTG AGG AGC TGG 3`

gas 6-2 5` CCG TCA ACC GAG AAG CGC T 3`

HGF 5` 5` GAC TTA CAT CGT CAT ATC TTC TGG GAA CC 3`

HGF 3` 5` CTG TAT CTC AAA CTA ACC ATC CAT CC 3`

GDNF 5` 5` GCG GAA TCG GCA GGC TGC AGC TGC C 3`

GDNF 3` 5` GGC GAT GGG TCT GCA ACA TGC CTG CCC 3`

MSP 5` 5` GAC ACA GTC CTA AAT GTG GCC 3`

MSP 3` 5` CCC CAA GGC ATA TGG CAT CAA GGT 3`

LimK 5` 5` GGG CGC TGG CTC ACT GGG CTC CCC 3`

LimK 3` 5` GCC CCG GAG CGT GCC GCC C 3`

SCF 5` 5` GGA GAA GGC TAC AGG GGC 3`

SCF 3` 5` GAC CCA GGG TCC ATG AGC 3`

c-kit 5` 5` CCT CCT TAC TCA TGG TCG G 3`

c-kit 3` 5` GGG CTG AGC ATC CGG AAG CC 3`

Amphiregulin 5` 5` CCG TCC TCG GGA GCC GAC TAT GAC 3`

Amphiregulin 3` 5` CAT GGA CTT TTC CCC ACA CCG TTC ACC G 3`

Heregulin 5` 5` GTG TGA ATG GAG GGG AGT GCT TCA TGG 3`

Heregulin 3` 5` GTT AAT GTT CTC ATG CGA CAG GCA GAG GC 3`

TGFα5` 5` GTG TTG GCT GCG TGC CAG GCC 3`

TGFα3` 5` CGG ACC TGG CAG CAG TGT ATC AGC 3`

hum-fra1 5` 5` CCA AGC ATC AAC ACC ATG AG 3`

hum-fra1 3` 5` AGG GAG ATA CAA GGT ACA GG 3`

fra1-rat 5` 5` CCT CCA GGG GTG CGA CGC AGG CCC 3`

fra1-rat 3` 5` GGG GCC CGG TGG GCT ACC CGC CCC 3`

erb B2 5` 5` CGC TTT GTG GTC ATC CAG 3`

erb B2 3` 5` CAC TGT ACC GCT GTA GAG 3`

erb B3 5` 5` GGT GAT GGT CAA GTG TTG G 3`

erb B3 3` 5` GGG CAT GTA TCC AGA TG 3`

erb B4 5` 5` GGT CAT GGT CAA ATG TTG G 3`

erb B4 3` 5` CCT CCA TCT CGG TAT AC 3`

EGF-R 5` 5` ACG GAA TCC CTG CCA GCG AG 3`

EGF-R 3` 5` TGC AAG CCA CGG TGG AAT TG 3`

2.1.4 Antikörper und Materialien für Proteinnachweise anti-Axl Antikörper; polyklonales Kaninchen

Antiserum gegen die extrazelluläre Domäne (N-Terminus), Aminosäuren 31-163

eigene Herstellung bei Eurogentec, Belgien

anti CD44 std (Klon SFF-2) Bender MedSystems, Wien anti CD44 v5 (Klon VFF 8) Bender MedSystems, Wien anti CD44 v6 (Klon VFF 7) Bender MedSystems, Wien anti CD44 v7/8 (Klon VFF17) Bender MedSystems, Wien

anti Ki67 (Klon MIB-1) dianova, Hamburg

anti Protein S Behring Diagnostics, Marburg

anti Gas6 Claudio Schneider, Triest

Goat anti-Mouse (E 0433) DAKO, Glostrup/Dänemark Swine anti-Rabbit (E 0353) DAKO, Glostrup/Dänemark

Vectastain ABC-Kit Vector Laborities, Bulinghame/CA

AEC Peroxidase Substrat Kit Vector Laborities, Bulinghame/CA DAB Peroxidase Substrat Kit Vector Laborities, Bulinghame/CA

Hämatoxylin Vector Laborities, Bulinghame/CA

Westernblot-Nitocellulose-Membran, 0,4µm Schleicher & Schuell, Dassel Whatman-3mm Papier Schleicher & Schuell, Dassel Semi-Dry-Elektroblotting Apparatur Biometra, Göttingen

2.1.5 Zellkulturmaterial

Aqua ad injectabila Braun, Melsungen

EDTA 0,02% Boehringer Mannheim Fötales Kälberserum, FCS Gibco BRL, Eggenstein

Geneticin, G418 Gibco BRL, Eggenstein

Glutamin, 200mM Seromed, Wertheim

PBS-Konzentrat Behring Werke, Marburg

RPMI 1640 Medium Gibco BRL, Eggenstein

Selenit, Transferrin, Insulin-Lösung Sigma, München CellTiter 96 Aquenouse One Solution

Proliferations Assay

Promega, Heidelberg

EGF, rekombinant aus S. cerivisiae upstate biotechnology, Lake Placid, NY

Gewebekulturflaschen Greiner; Frickenhausen

24 well-Schalen Greiner, Frickenhausen

Quadriperm-Schalen Heraeus, Hanau

Einfrierrörchen Greiner; Frickenhausen

Neubauerzählkammer Braun, Melsungen

Strerilfilter Millipore, Molsheim

Absaugpumpe Dunn, Aspach

Inkubator Hereaus, Hanau

Sterilbank, Laminar Flow Bioflow, Clan LAF, Meckenheim

Durchlicht-Mikroskop Leica, Heerburg/Schweiz

Umkehr-Mikroskop Leica, Heerburg/Schweiz

Stickstofftank, Chrono Biosafe Messer Griesheim

Wasserbad Hereaus, Hanau

2.1.6 Zellinien

2.1.6.1 Non Small Cell Lung Cancer-Zellinien

EPLC-32M1 Plattenepithelkarzinom

U1752 Plattenepithelkarzinom

LCLC-103H großzelliges Karzinom

U1810 großzelliges Karzinom

LCLC-97TM1 großzelliges Karzinom

NCI-H23 Adenokarzinom

NCI-H125 Adenokarzinom

NCI-H820 Adenokarzinom

NCI-H1573 Adenokarzinom

NCI-H2009 Adenokarzinom

NCI-H2077 Adenokarzinom

NCI-H2126 Adenokarzinom

2.1.6.2 Small Cell Lung Cancer-Zellinien

NCI-H22, -H24 kleinzelliges Karzinom

NCI-H60 kleinzelliges Karzinom

NCI-H69 kleinzelliges Karzinom

DMS79 kleinzelliges Karzinom

NCI-H82 kleinzelliges Karzinom

NCI-H146 kleinzelliges Karzinom

NCI-H510 kleinzelliges Karzinom

NCI-H526 kleinzelliges Karzinom

N592 kleinzelliges Karzinom

NCI-H841 kleinzelliges Karzinom

2.1.6.3 Normale humane Bronchialepithelzellen

NHBE Spenderzellen aus normalem Bronchialepithel

2.1.7 Bakterienkulturmaterial

Bakterien-Inkubator New Brunswick Scientific, USA

Bakterienbrutschrank Heraeus, Hanau

Agar Gibco BRL, Eggenstein

Chloramphenicol Sigma, München

Yeast-Extract Gicbo BRL, Eggenstein

Ampicillin Sigma, München

Select Peptone Gibco BRL, Eggenstein