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Dr. Ulrich Scheller
CH2 O
OH O O O O - P = O O - P = O O - P = O O-
Nukleinsäure Nukleinsäure Desoxyribose
Desoxyribose
Triphosphat Triphosphat Ein Nukleotid – Grundbaustein der DNA
23.01.2008
Dr. Ulrich Scheller Das menschliche Genom - Alphabet
des Lebens
Folie Nr. 2
DNA-Synthese: W
DNA-Synthese: Wie werden Nukleotide miteinander verknüpft?
CH2 O
OH O O O
-
O - P = O
-
O - P = O
-
O - P = O O-
Base CH2 O
OH O O O O - P = O O - P = O O - P = O O
Base
OH O O - P = O O - P = O O
O CH2 O O O O O - P = O O - P = O O - P = O O
Base
CH2 O
OH O O - P = O
Base
23.01.2008
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Folie Nr. 3
Die Kette wächst!
DNA-Polymerase
23.01.2008
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Folie Nr. 4
Didesoxynukleotid (ddNTP)
CH2 OOH O O O O - P = O O - P = O O - P = O O
Base
Desoxynukleotid (dNTP) Didesoxynukleotide
Didesoxynukleotide: : Eine wichtige OH-Gruppe wird entfernt
23.01.2008
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Folie Nr. 5
Einbauen von Fehlern:
Einbauen von Fehlern: ddNTP‘s
CH2 O
OH O O O O - P = O O - P = O O - P = O O
Base O
CH2
OH O O O O - P = O O - P = O O - P = O O
Base
Keine Reaktion!!!
Keine Reaktion!!!
23.01.2008
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Folie Nr. 6
Eine Sequenzierung = 4 Ansätze Eine Sequenzierung = 4 Ansätze
Ansatz A Ansatz C Ansatz G
H
T
H
C
H
G
Ansatz T
DNA Primer Polymerase
DNA Primer Polymerase
DNA Primer Polymerase
DNA
Primer
Polymerase
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Folie Nr. 7
Die Synthesereaktion:
Die Synthesereaktion: Eine Vorlage – viele verschiedene Produkte
23.01.2008
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Folie Nr. 8
Fragmente verschiedener Länge
Fragmente verschiedener Länge – – a aber das Ende ist gleich!!!
GCGTAAGGCATAGAC GC GCGTAAGGC
GCGTAAG
GCGTAAGGCATAG GCG
G
GCGTAAGGCATAGACG GCGTAAGG
Ansatz C Ansatz G Ansatz T Ansatz A
GCGTAAGGCAT GCGT
GCGTAAGGCATAGT GCGTA
GCGTAA GCGTAAGGCA GCGTAAGGCATA
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Folie Nr. 9
Ansatz C Ansatz G Ansatz T Ansatz A
---A ---A ---A ---A
---C ---C ---C
---G
---G ---G
G
---G ---G
---T ---T
---T
Fragmente verschiedener Länge Fragmente verschiedener Länge
aber das Ende ist gleich !!!
Fragmente verschiedener Länge Fragmente verschiedener Länge
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Folie Nr. 10
Gelelektrophorese
Gelelektrophorese: : Das Wirrwar wird geordnet A C G T
+ -
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Folie Nr. 11
G
Die Sequenz wird gelesen Die Sequenz wird gelesen
+ -
A C G T C
A G A T A C G G A A T G G
C
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Folie Nr. 12