9 Anhang
9.1 Materialliste
9.1.1 Geräte
Agarosegelkammer Midi-Wide, Biometra GmbH, Göttingen BioDocAnalyze System, Biometra GmbH, Göttingen Chirurgische Instrumente
Aesculap AG, Tuttlingen
WDT (Wirtschaftsgenossenschaft deutscher Tierärzte eG), Garbsen Elektophorese Power Pack P25, Biometra GmbH, Göttingen
Erlenmeyerkolben 500 ml, 2000 ml, Schott AG, Mainz
Extraktionsgerät Microlab Star, Hamilton Robotics GmbH, Martinsried Fireboy plus, Integra Biosciences GmbH, Fernwald
Gefriergeräte
Gefrierschrank -20°C, Liebherr-International Deutschland GmbH, Biberach an
der Riss
Gefriertruhe -20°C, Liebherr-International Deutschland GmbH, Biberach an
der Riss
Gefriertruhe -80°C, MDF-192, Sanyo Electric Biomedical Co., Tokyo, Japan Kühlblock für LightCycler® Kapillaren, Roche Diagnostics GmbH, Mannheim Messzylinder 100 ml, 1000 ml, Brand GmbH & Co. KG, Wertheim
Mikroskope
Laborlux S, Leitz GmbH, Wetzlar
Leica DM2500 mit Kamera DFC295, Leica Microsystems GmbH, Wetzlar Mikrowelle, Panasonic Marketing Europe GmbH , Wiesbaden
PCR-Geräte
Thermocycler T 3000, Biometra GmbH, Göttingen Thermocycler Tpersonal, Biometra GmbH, Göttingen LightCycler® 2.0, Roche Diagnostics GmbH, Mannheim
Mx3005Pro Stratagene, Applied Biosystems®, Life Technologies GmbH, Darmstadt
Pipetten
0,1-2,5 μl PreCision, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf 0,5-10 μl Proline, Biohit, Helsinki, Finnland
12,5 µl Matrixmehrkanalpipette, Thermo Scientific, New Hamshire, USA 5-50 μl Proline, Biohit, Helsinki, Finnland
50-200 μl PreCision, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf 10-100 µl Mehrkanalpipette, Brand GmbH & Co. KG, Wertheim 100-1000 μl PreCision, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf Schüttel-Heizblock, Pocket Bloc MB-102 Bioer, Biometra GmbH, Göttingen Sicherheitswerkbänke und PCR-Kabinette
Biocap, Erlab D.F.S S.A.S, Köln CaptairBio, Erlab D.F.S S.A.S, Köln
Kojair, Kojair Tech Oy, Vilppula, Finnland
Tecnoflow, Integra 2F120-II GS, Integra Bioscienes GmbH, Fernwald Vinitex LAB, Vinitex Laboreinrichtungen GmbH & Co. KG, Quickborn Software
BioDocAnalyze Systems Software, Version 2.1, Biometra GmbH, Göttingen GraphPad Prism® Software, Version 5.04, GraphPad Software, Inc., La Jolla,
USA
LightCycler® Software, Version 4.05, Roche Diagnostics GmbH, Mannheim Microlab Star Run, Version 4.2.1.6670, Hamilton Robotics GmbH, Martinsried Microsoft Office Professional Edition 2003/Professional 2010, Microsoft Corporation, Redmond, USA
MxPro Software, Version 4.10, Applied Biosystems®, Life Technologies
GmbH, Darmstadt
R, Version 2.15.1, R: A language and environment for statistical computing, R Core Team, R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria Thermocycler Manager Software, Version 2.0, Biometra GmbH, Göttingen Ständer, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf
Sterilisator, Memmert GmbH & Co. KG, Schwabach TissueLyser, Qiagen, Hilden
Vortex
LabDancer, Ika®-Werke GmbH & Co. KG, Staufen MS2 Minishaker, Ika®-Werke GmbH & Co. KG, Staufen Waagen
Feinwaage Kern 770, Kern & Sohn, Albstadt Plattformwaage, Soehnle, Leifheit AG, Nassau
Precision Advanced GT4100DV, Ohaus Corporation, Parsippany, USA Wipptisch WT 12 Biometra, Biometra GmbH, Göttingen
Zentrifugen
Centrifuge 5417C, Eppendorf, Hamburg
LightCycler® Carousel Centrifuge 2.0, Roche Diagnostics GmbH, Mannheim Plattenzentrifuge 2K15, Sigma Laborzentrifugen GmbH, Osterode am Harz Sprout Minizentrifuge, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf
9.1.2 Verbrauchsmaterialien
Chirurgische Einmal-Skalpelle, B. Braun Melsungen AG, Melsungen Gaskartuschen CV 360, Camping Gaz GmbH, Hattersheim
Handschuhe, Nobaglove®-Nitril, Noba Verbandmittel Danz GmbH & Co. KG, Wetter LightCycler® Capillaries 20 μl, Roche Diagnostics GmbH, Mannheim
Mikrotiterplatte, nerbe plus GmbH, Winsen/Luhe
Objektträger, Gerhard Menzel Glasbearbeitungswerk GmbH & Co. KG, Braunschweig
PP-Vlies-Mundschutz 3-lagig mit Gummiband, Hele GmbH, Heilsbronn Pipettenspitzen
10 μl SafeSeal-Tips, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf 12,5 μl Matrix-Pipettenspitzen, Thermo Scientific, New Hamshire, USA 50 μl Pipettenspitzen, nerbe plus GmbH, Winsen/Luhe
200 μl SafeSeal-Tips, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf 1000 µl High Volume Tips, Hamilton Robotics GmbH, Martinsried
1250 μl SafeSeal-Tips, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf Probengefäß 50 ml, Sarstedt AG & Co., Nümbrecht
Reaktionsgefäße
0,2 ml Multiply®-PCR-Gefäße, Sarstedt AG & Co., Nümbrecht 0,2 ml PCR 8er Cap- und SoftStrips®, Biozym Scientific GmbH, Hess.
Oldendorf
2,0 ml Eppendorf Safe-Lock Gefäß™, Eppendorf AG, Hamburg 2,0 ml Probenröhrchen, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf Stahlkugeln, Qiagen, Hilden
9.1.3 Chemikalien und Reagenzien
Agarose 3:1 Sieve, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf Aqua dest., LVIBS/H
Biguanid Fläche N, Dr. Schumacher GmbH, Melsungen DNA-Größenmarker, Amresco, Salon, USA
dNTP-Mix
BioChain Institute, Inc., Newark, USA Roche Diagnostics GmbH, Mannheim EDTA-Na2, Carl Roth GmbH & Co., Karlsruhe Essigsäure 100%ig, Merck KGaA, Darmstadt Ethanol 96%ig, Merck KGaA, Darmstadt
Ethidiumbromid, Sigma Chemical Co., St. Louis, USA Kohrsolin® FF, Paul Hartmann AG, Heidenheim
MgCl2, 25 mmol, Invitrogen™ Life Technologies GmbH, Darmstadt
M-MLV Reverse Transcriptase, Invitrogen™ Life Technologies GmbH, Darmstadt PBS (Dulbecco's)-Trockensubstanz ohne Ca2+/Mg2+ für 10l PBS-Lösung,
Biochrom AG, Berlin
Probenpuffer, Gel loading Solution, Sigma, Steinheim
Quantitas DNA Marker 50-2000bp, Biozym Scientific GmbH, Hess. Oldendorf Random Hexamers, Invitrogen™ Life Technologies GmbH, Darmstadt
RNaseOUT™ Recombinant Ribonuclease Inhibitor, Invitrogen™ Life Technologies GmbH, Darmstadt
Tris, AppliChem GmbH, Darmstadt
9.1.4 Kits
Adiavet® Lepto realtime, AES Chemunex GmbH, Bruchsal
GeneJET™ PCR Purification Kit, Fermentas, Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, USA
HotStarTaq®DNA Polymerase, Qiagen, Hilden
LightCycler®-FastStart DNA Master Hybridization Probe, Roche Diagnostics GmbH, Mannheim
LightCycler®-FastStart DNA Master SYBR Green I, Roche Diagnostics GmbH, Mannheim
LightMix® for the detection of Francisella tularensis, TIB® Molbiol GmbH, Berlin NucleoSpin® 8 Tissue, Machery-Nagel GmbH & Co. KG, Düren
NucleoSpin® 8 Virus, Machery-Nagel GmbH & Co. KG, Düren One Step RT-PCR Kit, Qiagen, Hilden
Parasiten-Diagnose-System, Janssen-Cilag GmbH, Neuss
Thermo-Start Taq DNA-Polymerase, Thermo Fisher Scientific, Inc., Waltham, USA
9.1.5 Positivkontrollen
B. procyonis: DNA-Eluat, Dr. Gereon Schares, Institut für Epidemiologie, FLI, Wusterhausen
C. burnetii: DNA-Eluat von C. burnetii-infizierten Zellkulturen, Dr. Klaus Henning, Nationales Referenzlabor für Q-Fieber, Wusterhausen
CDV: - cDNA-Eluat (Organspektrum) eines nachweislich (klinische Manifestation, Immunfluoreszenz, PCR) CDV-positiven Waschbären, LVIBS/H, Hannover
- cDNA-Eluat, Prof. Dr. Ludwig Haas, Institut für Virologie, Stiftung Tierärztliche Hochschue Hannover
Pathogene Leptospira spp.: DNA-Eluat (Milz), LVIBS/H, Hannover, bestätigt durch Dr. Karsten Nöckler, Konsiliarlabor für Leptospirose, BfR
9.1.6 Puffer und Lösungen EDTA-Na2-Lsg.,0,5 mol/l 186,1 g EDTA-Na2
ad 800 ml Aqua dest.
auf pH 8,0 einstellen ad 1000 ml Aqua dest.
15 Min. bei 121°C autoklavieren
Ethidiumbromid-Stammlösung
0,6 g Ethidiumbromid ad 1000 ml Aqua dest.
Ethidiumbromidlösung
2 ml Ethidiumbromid-Stammlösung ad 300 ml Aqua dest.
PBS-Puffer
PBS-Trockensubstanz (für 10 l) in 5 l Aqua dest. lösen ad 10 l Aqua dest. auffüllen portionieren zu je 500 ml Einheiten 30 Min. bei 121°C autoklavieren
TAE-Puffer, Stammlösung
242 g TRIS
57 ml Essigsäure (100%ig) 100 ml EDTA Na2-Lsg. (0,5 mol/L) ad 1000 ml Aqua dest.
TAE-Puffer; Laufpuffer (1:50)
20 ml TAE-Puffer-Stammlösung ad 1000 ml Aqua dest.