4.2 Stämme, Plasmide und Oligonukleotide
4.2.1 S. cerevisiae-Stämme
Die in dieser Arbeit verwendeten S. cerevisiae-Stämme sind in Tabelle 14 aufgeführt.
Mit Ausnahme von YHUM1800 (S288c-Stammhintergrund) sind alle aufgeführten Stämme Abkömmlinge des Σ1278b-Stammhintergrunds. Werden außer der systematischen Benennung „YHUM“ weitere Stammnamen angegeben, beziehen sich diese auf die angegebene Referenz.
Tabelle 14: Die in dieser Arbeit verwendeten S. cerevisiae-Stämme
Stamm Genotyp Referenz
YHUM0216 ura3-52, his::hisG, leu2::hisG, MATa. Σ1278b. Stammsammlung AG Mösch
YHUM0458 leu2Δ0, MATa. Σ1278b. Σ2000, MICROBIA Inc.
YHUM0909 ura3-52, MATa. Σ1278b. Stammsammlung AG
Mösch
YHUM0924 flo11Δ::kanR, ura3-52, MATa. Σ1278b. Stammsammlung AG Mösch
YHUM1455 dfg16Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die dfg16Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_DFG16 und rev_DFG16 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM0909 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_DFG16_SP und rev_DFG16_SP.
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129
Stamm Genotyp Referenz
YHUM1459 nrg1Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die nrg1Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_NRG1 und rev_NRG1 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM0909 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_NRG1_SP und rev_NRG1_SP.
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YHUM1461 rim101Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die rim101Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_RIM101 und rev_RIM101 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM0909 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996). Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_RIM101_SP und rev_RIM101_SP.
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YHUM1463 smp1Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die smp1Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_SMP1 und rev_SMP1 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM0909 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_SMP1_SP und rev_SMP1_SP.
diese Arbeit
YHUM1514 nrg2Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die nrg2Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_NRG2 und rev_NRG2 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM0909 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_NRG2_SP und rev_NRG2_SP.
diese Arbeit
YHUM1522 rim101Δ::loxP, nrg1Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die nrg1Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_NRG1 und rev_NRG1 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1461 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_NRG1_SP und rev_NRG1_SP.
diese Arbeit &
(Mark, 2008)
YHUM1524 rim101Δ::loxP, smp1Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die smp1Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_SMP1 und rev_SMP1 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1461 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_SMP1_SP und rev_SMP1_SP.
diese Arbeit &
(Mark, 2008)
YHUM1528 rim101Δ::kanMX4, leu2Δ0, MATa. Σ1278b.
Die rim101Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_RIM101 und rev_RIM101 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM0458 integriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_RIM101_SP und rev_RIM101_SP.
diese Arbeit
Material
130
Stamm Genotyp Referenz
YHUM1530 nrg1Δ::loxP, nrg2Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die nrg2Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_NRG2 und rev_NRG2 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1459 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_NRG2_SP und rev_NRG2_SP.
diese Arbeit &
(Mark, 2008)
YHUM1564 rim101Δ::loxP, nrg1Δ::loxP, nrg2Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die nrg2Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_NRG2 und rev_NRG2 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1522 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_NRG2_SP und rev_NRG2_SP.
diese Arbeit &
(Mark, 2008)
YHUM1566 rim101Δ::loxP, smp1Δ::loxP, nrg1Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die nrg1Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_NRG1 und rev_NRG1 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1524 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_NRG1_SP und rev_NRG1_SP.
diese Arbeit &
(Mark, 2008)
YHUM1570 rim101Δ::loxP, nrg2Δ::loxP, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die nrg2Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_NRG2 und rev_NRG2 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1461 integriert. Der Deletionsstamm wurde mit pSH47 (BHUM0094) transformiert und der kanMX4-Marker durch Induktion der Cre-Rekombinase regeneriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_NRG2_SP und rev_NRG2_SP.
diese Arbeit &
(Mark, 2008)
YHUM1574 smp1Δ::loxP, nrg2Δ::kanMX4,ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die nrg2Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_NRG2 und rev_NRG2 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1463 integriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_NRG2_SP und rev_NRG2_SP.
diese Arbeit &
(Mark, 2008)
YHUM1576 rim101Δ::loxP, smp1Δ::loxP, nrg2Δ::kanMX4, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die nrg2Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_NRG2 und rev_NRG2 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1524 integriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_NRG2_SP und rev_NRG2_SP.
diese Arbeit &
(Mark, 2008)
YHUM1578 NRG1-3HA-CaURA3, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die 3HA-CaURA3-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_NRG1_3HA und S2_rev_NRG1_3HA aus BHUM1300 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter NRG1 in YHUM0909 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_NRG1_Cterm und rev_NRG1_Cterm.
diese Arbeit
131
Stamm Genotyp Referenz
YHUM1580 NRG2-3HA-CaURA3, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die 3HA-CaURA3-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_NRG2_3HA und S2_rev_NRG2_3HA aus BHUM1300 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter NRG2 in YHUM0909 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_NRG2_Cterm und rev_NRG2_Cterm.
diese Arbeit
YHUM1582 SMP1-3HA-CaURA3, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die 3HA-CaURA3-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_SMP1_3HA und S2_rev_SMP1_3HA aus BHUM1300 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter SMP1 in YHUM0909 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_SMP1_Cterm und rev_SMP1_Cterm.
diese Arbeit
YHUM1584 NRG1-3HA-CaURA3, rim101Δ::loxP, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die 3HA-CaURA3-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_NRG1_3HA und S2_rev_NRG1_3HA aus BHUM1300 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter NRG1 in YHUM1461 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_NRG1_Cterm und rev_NRG1_Cterm.
diese Arbeit
YHUM1586 NRG2-3HA-CaURA3, rim101Δ::loxP, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die 3HA-CaURA3-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_NRG2_3HA und S2_rev_NRG2_3HA aus BHUM1300 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter NRG2 in YHUM1461 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_NRG2_Cterm und rev_NRG2_Cterm.
diese Arbeit
YHUM1588 SMP1-3HA-CaURA3, rim101Δ::loxP, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die 3HA-CaURA3-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_SMP1_3HA und S2_rev_SMP1_3HA aus BHUM1300 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter SMP1 in YHUM1461 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_SMP1_Cterm und rev_SMP1_Cterm.
diese Arbeit
YHUM1592 (WY423)
PFLO11-FLO111-30-3HA-FLO1131-Ende-TFLO11, ura3-52, his::hisG, leu2::hisG, MATa. Σ1278b.
(Guo et al., 2000)
YHUM1593 rim101Δ::loxP, sfl1Δ::kanMX4, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die sfl1Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_SFL1 und rev_SFL1 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1461 integriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_SFL1_SP und rev_SFL1_SP.
diese Arbeit
YHUM1596 rim101Δ::loxP, cnb1Δ::kanMX4, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die cnb1Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_CNB1 und rev_CNB1 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1461 integriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_CNB1_SP und rev_CNB1_SP.
diese Arbeit
Material
132
Stamm Genotyp Referenz
YHUM1602 rim101Δ::loxP, srb8Δ::kanMX4, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die srb8Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_SRB8 und rev_SRB8 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1461 integriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_SRB8_SP und rev_SRB8_SP.
diese Arbeit
YHUM1610 NRG1-3HA-kanMX6, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die 3HA-kanMX6-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_NRG1_3HA und S2_rev_NRG1_3HA aus BHUM1178 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter NRG1 in YHUM0909 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_NRG1_Cterm und rev_NRG1_Cterm.
Stammsammlung AG Mösch (Schäfer, 2009)
YHUM1612 NRG2-3HA- kanMX6, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die 3HA- kanMX6-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_NRG2_3HA und S2_rev_NRG2_3HA aus BHUM1178 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter NRG2 in YHUM0909 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_NRG2_Cterm und rev_NRG2_Cterm.
Stammsammlung AG Mösch (Schäfer, 2009)
YHUM1614 SMP1-3HA- kanMX6, ura3-52, MATa. Σ1278b.
Die 3HA- kanMX6-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_SMP1_3HA und S2_rev_SMP1_3HA aus BHUM1178 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter SMP1 in YHUM0909 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_SMP1_Cterm und rev_SMP1_Cterm.
Stammsammlung AG Mösch (Schäfer, 2009)
YHUM1618 NRG1-3HA- kanMX6, rim101Δ::loxP, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die 3HA- kanMX6-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_NRG1_3HA und S2_rev_NRG1_3HA aus BHUM1178 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter NRG1 in YHUM1461 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_NRG1_Cterm und rev_NRG1_Cterm.
Stammsammlung AG Mösch (Schäfer, 2009)
YHUM1620 NRG2-3HA- kanMX6, rim101Δ::loxP, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die 3HA- kanMX6-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_NRG2_3HA und S2_rev_NRG2_3HA aus BHUM1178 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter NRG2 in YHUM1461 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_NRG2_Cterm und rev_NRG2_Cterm.
Stammsammlung AG Mösch (Schäfer, 2009)
YHUM1622 SMP1-3HA- kanMX6, rim101Δ::loxP, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die 3HA- kanMX6-Markierungskassette wurde mit Hilfe der Primer S3_fw_SMP1_3HA und S2_rev_SMP1_3HA aus BHUM1178 amplifiziert und chromosomal C-terminal hinter SMP1 in YHUM1461 integriert (Knop et al., 1999). Überprüft durch PCR mit den Primern fw_SMP1_Cterm und rev_SMP1_Cterm.
Stammsammlung AG Mösch (Schäfer, 2009)
133
Stamm Genotyp Referenz
YHUM1654 rim101Δ::loxP, srb10Δ::kanMX4, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die srb10Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_SRB10 und rev_SRB10 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1461 integriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_SRB10_SP und rev_SRB10_SP.
diese Arbeit
YHUM1814 rim101Δ::loxP, snf1Δ::kanMX4, ura3-52, MATa.
Σ1278b.
Die snf1Δ::kanMX4-Deletionskassette wurde mit Hilfe der Primer fw_SNF1 und rev_SNF1 aus pUG6 (BHUM0966) amplifiziert und chromosomal in YHUM1461 integriert (Güldener et al., 1996).
Überprüft durch eine Southern-Hybridisierung mit einer Sonde aus fw_SNF1_SP und rev_SNF1_SP.
diese Arbeit
YHUM1800 (Y00381)
rim101Δ::kanMX4, his3Δ1, leu2Δ0, met15Δ0, ura3Δ0, MATa. BY4741.
EUROSCARF
Material
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