Elektrophorese
Elektrophorese
Allgemein:
Wanderung geladener Teilchen im elektrischen Feld Analytische Chemie:
Trennung von Ionen im elektrischen Feld
(Elektrophoretische Trenntechniken zählen
im Allgemeinen nicht zur Chromatographie)
„Chromatographie-Check“
Damit eine Technik eine Chromatographie ist, müssen folgende Punkte vorhanden bzw. erfüllt sein:
• Trenntechnik
• Zwei nicht mischbare Phasen
• Eine mobile und eine stationäre Phase
• Trennung beruht auf der Verteilung von Substanzen zwischen den Phasen
• Kontinuierliche Abfolge von Gleichgewichtseinstellungen
Übersicht Elektrophorese:
• Gel-Elektrophorese
• Agarose-Gelelektrophorese, Polyacrylamid-Gelelektrophorese (PAGE)
• Natriumdodecylsulfat-PAGE (SDS-PAGE)
• Kapillarelektrophorese (CE)
• Kapillarzonenelektrophorese (CZE)
• Mizellare Elektrokinetische Chromatographie (MEKC)
Gel-Elektrophorese
Gel-Elektrophorese
Gel-Elektrophorese: http://www.youtube.com/watch?v=qMxQ-65qYDk
Agarose-Gelelektrophorese
Polyacrylamid-Gelelektrophorese (PAGE)
• Moleküle wandern entsprechend ihrer Ladung im elektrischen Feld
• Das Gel behindert die Moleküle bei ihrer Wanderung
• Kleine Moleküle wandern schneller als grosse
• Detektion: chemische Anfärbemethoden (z.B. Fluoreszenz)
• Trennung aufgrund von Ladung und Molekülgrösse
• z.B. Auftrennung von DNA-Fragmenten (z.B. „Genetischer Fingerabdruck)
–
+
Standard Probe
Probe: DNA-Fragment mit 522 Basenpaaren (bp)
Probenauftragung
Agarose-Gelelektrophorese, Polyacrylamid- Gelelektrophorese (PAGE)
Z.B.: DNA fingerprinting
• Trennung nach
Ladung und Grösse
• Grösse:
hydrodynamischer Durchmesser
• Proteine werden also nach Ladung, Molekulargewicht und Faltung getrennt
• Bei Proteinen wird häufig die SDS-PAGE angewandt
SDS-PAGE
SDS = sodium dodecyl sulfate Natriumdodecylsulfat Natriumlaurylsulfat C12H25NaO4STensid, Detergent =
Herabsetzen der Grenzflächenspannung zwischen zwei Phasen
z.b.: Öl und Wasser fein vermengbar
SDS bildet Mizellen
SDS denaturiert Proteine SDS bildet negativ geladene
Komplexe mit Proteinen
SDS-PAGE
• Trennung von negativ geladenen Komplexen
von SDS mit denaturierten, entfalteten Proteinen
• Faltung beeinflusst nicht die Trennung
• Zahl der SDS-Moleküle pro Protein hängt nur vom
Molekulargewicht ab,
Eigenladung der Proteine spielt keine Rolle
• Trennung von Proteinen nur aufgrund des
Molekulargewichts
SDS-PAGE
• Trennung von negativ geladenen Komplexen
von SDS mit denaturierten, entfalteten Proteinen
• Faltung beeinflusst nicht die Trennung
• Zahl der SDS-Moleküle pro Protein hängt nur vom Molekulargewicht ab,
Eigenladung der Proteine spielt keine Rolle
• Trennung von Proteinen nur aufgrund des
Molekulargewichts
SDS-PAGE-Trennung verschiedener Proteine (1-8) gemäss ihres Molekulargewichts.
Links: Gemisch von Proteinen bekannter Grösse als Molekulargewichtsstandard (14–97 kDa)
Übersicht Elektrophorese:
• Gel-Elektrophorese
• Agarose-Gelelektrophorese, Polyacrylamid-Gelelektrophorese (PAGE)
• Natriumdodecylsulfat-PAGE (SDS-PAGE)
• Kapillarelektrophorese (CE)
• Kapillarzonenelektrophorese (CZE)
• Mizellare Elektrokinetische Chromatographie (MEKC)
Kapillarelektrophorese
(capillary electrophoresis = CE)
Migration eines Ions im elektrischen Feld E
Analyten müssen „geladen“ sein (basische oder acide Analyten) Elektrophorese ist keine
Chromatographie!
Adenosine Triphosphate Neuraminsäuren
CE: Theoretische Grundlagen
µ
EP= v
E = Geschwindigkeit eines Ions
Elektrische Feldstärke = e 6 π ⋅
1 η ⋅
z r
e ... Elementarladung
η ... Viskosität der Pufferlösung z ... Ladung des Ions
r ... Hydrodynamischer Durchmesser des Ions
Elektrophoretische Mobilität µEP eines Ions im elektrischen Feld E
Konstante Pufferlösung Ion (Analyt)
Trennung
aufgrund von Ladung und
CE: Theoretische Grundlagen
Migration der Ionen im elektrischen Feld
+ –
Anode Kathode
Nach dem Probeneinlass wird Spannung angelegt (bis zu 30.000V) Analytionen trennen sich nach Ladung (und Grösse)
Analyt
-
Analyt+
Analyt
-
Analyt
+
Analyt
+
Analyt
-
µEP = v
E =Geschwindigkeit eines Ions Elektrische Feldstärke = e
6π⋅ 1 η⋅ z
r
Anionen wandern in Richtung Anode und
Kationen in Richtung Kathode
Man würde in diesem Fall nur die Kationen detektieren…
Probeneinlass
Analyt
-
Detektor
CE: Theoretische Grundlagen
Elektroosmotischer Fluss (EOF) bei Quartzkapillaren
+ –
Anode Kathode
EOF
Aufgrund der negativ geladenen Innenwand der Quarzkapillare bildet sich ein Fluss der Pufferlösung in Richtung Kathode aus, der elektroosmotische Fluss (EOF).
Quarzkapillare (SiO2)
Quarzkapillare (SiO2)
Analyt
-
Analyt+
Kapillarzonenelektrophorese (CZE)
Kationen Neutrale Moleküle (ungetrennt) Anionen
• Trennung von
Kationen und Anionen
• Neutrale Moleküle verlassen ungetrennt mit dem EOF die Kapillare
• Detektor wegen EOF
kathodenseitig angebracht
• Nur Anionen, die schneller als der EOF wandern, erreichen den Detektor nicht
Aufbau eines CE Systems:
Fused silica capillaries High voltage power supply
(with platin electrodes)
2 x glass vials
A) B) C)
A
B B
C
D)
D) Detector
Detektion:
In der Regel UV Detektoren Kopplung an Massen-
Spektrometrie ist schwierig
Trennung:
Spannung (+/-) Kapillarlänge Puffer
Trennung von Metaboliten:
75cm Kapillare
Voltage: -15/-20/-25/-30 Ammonia bicarbonate EOF block, pumping
CE: Beispiel
Elektropherogram
Detektion:
In der Regel UV Detektoren Kopplung an Massen-
Spektrometrie ist schwierig
CE: Beispiel
Zusammenfassung Elektrophorese
Elektrophorese
• Gel-Elektrophorese
• Agarose-Gelelektrophorese,
Polyacrylamid-Gelelektrophorese
• Natriumdodecylsulfat-PAGE
• Kapillarelektrophorese
• Kapillarzonenelektrophorese
• Mizellare Elektrokinetische Chromatographie
Übersicht
• Gel-Elektrophorese
• Agarose-Gelelektrophorese, Polyacrylamid-Gelelektrophorese (PAGE)
• Trennung geladener Makromoleküle (z.B. DNA-Fragmente)
• Trennung aufgrund von Ladung und Grösse (Faltungszustand)
• Natriumdodecylsulfat-PAGE (SDS-PAGE)
• Trennung von Proteinen (als SDS-Protein-Komplex)
• Trennung nur aufgrund des Molekulargewichts
• Kapillarelektrophorese (CE)
• Kapillarzonenelektrophorese (CZE)
• Trennung geladener, kleiner Moleküle (z.B. Aminosäuren, Ionen)
• Trennung von Kationen und Anionen (wegen EOF)
• Mizellare Elektrokinetische Chromatographie (MEKC)
• Trennung ungeladener, kleiner Moleküle
• Trennung aufgrund der Polarität (Elutionsreihenfolge analog RP-HPLC)
Agarose-Gelelektrophorese
Polyacrylamid-Gelelektrophorese (PAGE)
• Moleküle wandern entsprechend ihrer Ladung im elektrischen Feld
• Das Gel behindert die Moleküle bei ihrer Wanderung
• Kleine Moleküle wandern schneller als grosse
• Detektion: chemische Anfärbemethoden (z.B. Fluoreszenz)
• Trennung aufgrund von Ladung und Molekülgrösse
z.B.: Auftrennung von DNA-Fragmenten („Genetischer Fingerabdruck“)
–
+
Standard Probe
Probe: DNA-Fragment
Proben Aufbringung
SDS-PAGE
SDS = sodium dodecyl sulfate Natriumdodecylsulfat Natriumlaurylsulfat C12H25NaO4STensid, Detergent =
Herabsetzen der Grenzflächenspannung zwischen zwei Phasen
z.b.: Öl und Wasser fein vermengbar
SDS bildet Mizellen
SDS denaturiert Proteine SDS bildet negativ geladene
Komplexe mit Proteinen
SDS-PAGE
• Trennung von negativ geladenen Komplexen
von SDS mit denaturierten, entfalteten Proteinen
• Faltung beeinflusst nicht die Trennung
• Zahl der SDS-Moleküle pro Protein hängt nur vom
Molekulargewicht ab,
Eigenladung der Proteine spielt keine Rolle
• Trennung von Proteinen nur aufgrund des
Molekulargewichts
Kapillarelektrophorese
(capillary electrophoresis = CE)
Migration eines Ions im elektrischen Feld E
z.b.: Kapillarzonenelektrophorese Analyten müssen „geladen“ sein (basische oder acide Analyten) Elektrophorese ist keine
Chromatographie!
Adenosin Triphosphat Neuraminsäure
Detektion:
In der Regel UV Detektoren Kopplung an Massen-
Spektrometrie ist schwierig Trennung:
Spannung (+/-) Kapillarlänge Puffer
75cm Kapillare
Voltage: -15/-20/-25/-30 Ammonia bicarbonate EOF block, pumping
àTrennung von Metaboliten
CE: Beispiel
Elektropherogramm
Herbstsemester 2015 ETH Zurich | Dr. Thomas Schmid | Dr. Martin Badertscher, martin.badertscher@org.chem.ethz.ch
Mizellare Elektrokinetische Chromatographie (MEKC)
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Dem Puffer wird ein Tensid (z.B. SDS) zugegeben, welches Mizellen bildet.
siehe SDS-PAGE!
Abhängig von ihrer Polarität halten sich die Analyten v.a.
in der Pufferlösung (polar) oder in den Mizellen (unpolar) auf.
• Trennung ungeladener Analyten (keine Ionen)
• Chromatographie
• Mobile Phase: Pufferlösung (polar)
• Pseudo-stationäre Phase: Mizellen (unpolar)
Mizellare Elektrokinetische Chromatographie (MEKC)
• Trennung von
ungeladenen Analyten
• Pufferlösung (mobile Phase) bewegt sich wegen EOF in Richtung Kathode
• Mizellen (pseudo-stationäre
Phase) bewegen sich langsamer
• Elutionsreihenfolge wie in RP-HPLC: polare Moleküle eluieren vor unpolaren
• Detektor wegen EOF
kathodenseitig angebracht
hoch gering