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Algorithmen auf Sequenzen

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Academic year: 2022

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Ludwig-Maximilians-Universit¨at M¨unchen Institut f¨ur Informatik

Prof. Dr. Volker Heun

Wintersemester 2017/18 Ubungsblatt 7¨ 7. Dezember 2017

Algorithmen auf Sequenzen

Abgabetermin: Donnerstag, den 14. Dezember vor der Vorlesung

Aufgabe (Notenbonus) 1

Wende den Conquer-Step aus dem Algorithmus von Main und Lorentz auf das folgende Wort

t=t1· · ·t20 =abaabbabbabbabbabbaa

f¨ur h=⌊n2⌋= 10 und q=h+ℓ an (also nur Schritt 3). Gib dazu f¨ur jedes ℓ∈[3 : 6] die ausgef¨uhrten LCE-Anfragen und die ausgegebenen Tandem-Repeat-Paare an (gib zus¨atz- lich an, welche davon rechtsverzweigend sind).

Aufgabe (Notenbonus) 2

Gib einen Algorithmus an, der die Lempel-Ziv-Zerlegung einer Zeichenreihe in Linearzeit bestimmt.

Hinweis: Korrektheitsbeweis und Laufzeitanalyse nicht vergessen!

Aufgabe 3

Gegeben sei eine Zeichenreihe t∈ Σ. Ein Wort w ∈Σ heißt minimal rechts bzw. links- eindeutiges Teilwort von t, wennwgenau einmal int auftritt und wenn jedes Pr¨afix bzw.

Suffix von w mindestens zweimal in t auftritt.

a) Entwirf einen effizienten Algorithmus zum Auffinden aller minimal rechts-eindeutigen Teilw¨orter der L¨ange mindestens ℓ, beweise seine Korrektheit und analysiere seine Laufzeit.

b) Entwirf einen effizienten Algorithmus zum Auffinden aller minimal links-eindeutigen Teilw¨orter der L¨ange mindestens ℓ, beweise seine Korrektheit und analysiere seine Laufzeit.

Referenzen

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