Synthetische Oligonukleotide - Material und Methoden

4 Material und Methoden

4.1 Material

4.1.9 Synthetische Oligonukleotide

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) NOC1

178

TAATTTACAACACCGAAGTGTTTAGT TAATGTATTATTATTTTTACGACTCA CTATAGGG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) NOC1

638

GCCAAACAAAAAGCTAAACTGAATA AACTAGATTCCAAGAAATCCATGGA AAAGAGAAG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) NOP7

639

AGACAAAATTTTTGAGAGGCTATTG GAAAAGAAGAGAAAATACGACTCAC TATAGGG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) NOP7

---

AAATCTAAAAATGGATAAACTAGGAA ACTATATACTAGAGTCCATGGAAAA GAGAAG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) RIO2

---

TTGATTATTTGCGGCCATTTATGCAG TCGTCTAAACTAAATACGACTCACTA TAGGG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) RIO2

646

CGAATTAAGTGATGACGAAGAGGAG GAGGAAGAAGGAGAATCCATGGAAA AGAGAAG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) RIX1

647

TCTAGTCGAAATATAACCAAACAAAA TCTGGTTGATATTATACGACTCACTA TAGGG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) RIX1

648

TGAGACATCAAATGGCGGAGTTGAA GAAACCATGAAAATGTCCATGGAAA AGAGAAG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) ARX1

649

TATATTATTTATATACTAGCTTTAGAA ATGATGAAGTTTCTACGACTCACTAT AGGG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) ARX1

---

TCCACAGGAAGCTAATGATGATTTA ATGATTGATGTCAATTCCATGGAAAA GAGAAG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) ENP1

---

CCGAGCGATATAAAATTGATGAAAA ATTGATATTACAGCATACGACTCACT ATAGGG

PCR zur genomischen Integration des

TAP-Tags (mit pBS1479 als Matrize) ENP1

205 CATGGCTTAATCTTTGAGAC Radioaktiv markierte Sonde zur

Hybridisierung in 18S–Sequenz rDNA

212 CTCCGCTTATTGATATGC Radioaktiv markierte Sonde zur

Hybridisierung in 25S-Sequenz rDNA

Promotor in pGEMT (T7-Pr_5.8S-B1_f) rDNA

1883 AAATGACGCTCAAACAGGCATGCC Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (5.8S-E_rev) rDNA

1884 ACCGTACTTGCATTATACCTCAAG Klonierung von rDNA-Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (7S-C2_rev) rDNA

1885 TAATACGACTCACTATAGGGGTTTG ACCTCAAATCAGGTAGGAGT

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Pr_25S-DomI_f) rDNA

1886 CCGTGTTTCAAGACGGGCGGCATA Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (25S-DomI_rev) rDNA

1887 TAATACGACTCACTATAGGGACCAA GGAGTCTAACGTCTATGCGA

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Pr_25S-DomII_f) rDNA

1888 CTACTACCACCAAGATCTGCACTA Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (25S-DomII_rev) rDNA

1889 TAATACGACTCACTATAGGGCAAAT ATTCAAATGAGAACTTTGAA

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Pr_25S-DomIII_f) rDNA

1890 CAACTAGAGGCTGTTCACCTTGGA Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (25S-DomIII_rev) rDNA

1891 TAATACGACTCACTATAGGGATAGA ATAATGTAGATAAGGGAAGT

Klonierung von rDNA-Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Pr_25S-DomIV_f) rDNA

1892 TGCCAAGCCCGTTCCCTTGGCTGT Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (25S-DomIV_rev) rDNA

1893 TAATACGACTCACTATAGGGGAATC AGCGGGGAAAGAAGACCCTG

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Pr_25S-DomV_f) rDNA

1894 ATTCATCAGTAGGGTAAAACTAAC Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (25S-DomV_rev) rDNA

1895 TAATACGACTCACTATAGGGGTTAC CGCAATAGTAATTGAACTTA

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Pr_25S-DomVI_f) rDNA

1896 ACAAATCAGACAACAAAGGCTTAA Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (25S-DomVI_rev) rDNA

1897 TAATACGACTCACTATAGGGTGCCT GTTTGAGCGTCATTTCCTTC

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Pr_ITS2_for) rDNA

1898 TACCTGATTTGAGGTCAAACTTTA Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (ITS2_rev) rDNA

1899 TAATACGACTCACTATAGGGGCTCG TGTAGCTCAGTGGTTAGAGC

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Pr_Ile-tRNA_f) rDNA

1900 TGCTCGAGGTGGGGTTTGAACCCA Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (Ile-tRNA_rev) rDNA

1952 TAATACGACTCACTATAGGGTATCT GGTTGATCCTGCCAGTAGTC

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-P_18S-DomI_f) rDNA

1953 CTTTAATATACGCTATTGGAGCTG Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (18S-DomI_rev) rDNA

1954 TAATACGACTCACTATAGGGTTGTT GCAGTTAAAAAGCTCGTAGT

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-P_18S-DomII_f) rDNA

1955 CTTTAAGTTTCAGCCTTGCGACCA Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (18S-DomII_rev) rDNA

1956 TAATACGACTCACTATAGGGGAATT GACGGAAGGGCACCACCAGG

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-P_18S-Dom3_f) rDNA

1957 TAATGATCCTTCCGCAGGTTCACC Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (18S-DomIII_rev) rDNA

1958 GTTGTATTGAAACGGTTTTAATTG Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (18S-DomIII+A2_r) rDNA

1959 TTGTTACCTCTGGGCCCCGATTGC Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (18S-DomIII+A3_r) rDNA

1960 TAATACGACTCACTATAGGGGGATC ATTAAAGAAATTTAATAATT

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Prom_ITS1_for) rDNA

1961 GCGAGAACCAAGAGATCCGTTGTT Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (ITS1_rev) rDNA

1962 TAATACGACTCACTATAGGGGGTTG CGGCCATATCTACCAGAAAG

Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (T7-Prom_5S_for) rDNA

1963 ATTGCAGCACCTGAGTTTCGCGTA Klonierung von rDNA–Fragmenten mit T7–

Promotor in pGEMT (5S_rev) rDNA

2152 GGCGAATTGGGCCCGACG Sequenzierung der rDNA–Fragmente in

pGEMT (pGEMT-seq-for) pGEMT

1964

TCGACGAGGGATCCGGCGCCCTGA AAATACAGGTTTTCCAGGATCTTATC GTCGTCATCCTTGTAATCCATA

Einbau des Flag-Epitops in die MCS2 der Multibac-Plasmide mittels Primer-Annealing

Einbau des 6xHis-Tags in die MCS2 der Multibac-Plasmide mittels Primer-Annealing (6xHis_for)

His-Tag

1967 TCGACGAGGGATCCGTAATCGTGAT GGTGATGGTGATGCATA

Einbau des 6xHis-Tags in die MCS2 der Multibac-Plasmide mittels Primer-Annealing (6xHis_rev)

His-Tag

1968 TTTTTTGTCGACATGGGTAAAGTTTC TAAATC