6. Anhang
6.2 Sequenzvergleich der murinen AP-2β-cDNS mit der murinen
(Übertragung der Exongrenzen von AP-2β auf AP-2γ. Die Exongrenzen wurden farblich markiert.)
β 1 ...GAATTCAAGCGTTTTTCTGTCTGCTGAGGCTTACTTCTCCAG | || || | | | | | γ 1 GCTTCTCCGGTCCACGGCTGCGGCCTCTACACACCCACGGCGACCACATC β 43 CCTATTGTTTGAGACAACAGATATAAGTTGCGATGGGAGAGGAGCGTCGG
|| | | || | ||||| || | | |||
γ 51 TCTGTGCACAGCCACCGATGCGCGTCCAGTGACTGGGACAGCAAGGCCGG β 93 ATTTGGTGTGTATCCCCCATTTCCAATTATAGATGGATCATTACAGACAG | | | | | | | || | γ 101 CGCGCGCGGCGGGGGCGGCGGCAGACGCCTGGCCACCGTGACCCCGATTG β 143 CGGAGTCCTGAGAAACCAGACATCTGCTCCTCACATGAATGCACTCACCT
||| | | | | || | ||
γ 151 TGGATTTACCGCTCGGGGGGTGGGGGGAGCCTGGATTTAACTGGCGACTA Exon1 ->
β 193 CCTAGAGACCAGGCTGCGATCATGCTCTGGAAACTCGTGGAGAATGTCAA | | | | | | |||| | |||||| | || ||||||||
γ 201 TTTTGGGGGACGCCGGACGCCATGTTGTGGAAAATAACAGATAATGTCAA <- Exon1 Exon2 ->
β 243 GTACGAAGACATCTATGAGGACCGGCACGATGGCGTCCCAAGCCATAGCT ||| ||||| | ||||| || ||||| | | | | γ 251 GTATGAAGAGGATTGCGAGGATCGCCACGACTCGAGCAGTAATGGCAACC β 293 CGAGACTCTCTCAACTGGGCTCTGTGTCCCAAGGACCCTACTCAAGCGCC
| | || |||| || |||| | ||| | |||| |||
γ 301 CTCGCATCCCTCACCTCTCCTCTCCGGGACAACATCTCTACAGTCCCGCG β 343 CCGCCGCTGTCCCACAC...GCCATCATCGCACTTCCAGCCACCCTACTT
||||| || || ||||| | || | || | ||| || |||||
γ 351 CCGCCTCTCTCGCACACCGGGGTTGCAGAGTACCAGCCGCCTCCTTACTT β 390 TCCGCCCCCCTACCAGCCGCTACCCTACCACCAGAGTCAAGACCCGTACT
||||| || ||||||| | | ||| ||| |||| ||||
γ 401 CCCGCCGCCTTACCAGCAGGTGGTATACTCGCAGTCCGCCGACCATTACT β 440 CCCACGTCAACGATCCCTA...CTCCCTGAACCCTCTGCATCAGCC.
| || | || | || | || ||||||| ||||| |||||
γ 451 CGCATCTGGGACAGGCTTACGCTGCCGCCATGAACCCCCTGCACCAGCCT β 483 ...CCAGCAGCACCCGTGGGGGCAACGGCAACGCCAAGAAGT | ||||| | | ||| | | || | | γ 501 GCGGCCACCGGCAGCCAGCAACAGGCCTGGCCGGGTCGACAGAGTCAGGA
β 522 GGGCTCAGAAGCCGGCTCTCTCCTGCCCCAGCCCCGGGCAGCCTTGCCCC |||||| | ||| | || || | | ||||
γ 551 GGGCTCTAGCCTGGCCTCGCACCACAGCCGCTCTGCAAGTCTAATACCCC β 572 AGCTCTCCGGCCTTGA...TCCCCGAAGGGACTACCACTCTGTCCGC
| | || || || || | || | | | ||| | γ 601 ATATTTCAGGGCTGGAGGGGGGCTCGGTGAGCGCCCGGCGGGAAGTCTAC β 616 CGGCCGGACGTGCTGCTGCATTCCGCACATCACGGCCTGGACGCCGGCAT
|| | | || ||||||| | |||| |||||| |||||| | γ 651 CGCCGGTCCGACCTGCTGCTGCCTCACGCGCACGCCCTGGAAGCCGGCCT β 666 GGGCGACAGCCTCTCGTTGCACGGCCTTGGGCATCCCGGCATGGAAGACG
|| || | ||| | |||||| | | || || ||| || || | γ 701 GGCTGAGAACCTGGGGCTGCACGAGATGGCTCACCC...CATAGAGGAGG <- Exon2 Exon3 ->
β 716 TGCAGTCAGTTGAAGATGCCAATAACAGCGGCATGAACCTATTGGACCAG ||||| || || || || | | || |||| || |||
γ 748 TGCAGAATGTGGACGACGCGCA...CTTGCTCCTACACGATCAG <- Exon3 Exon4 ->
β 766 TCAGTCATTAAAAAAGTTCCTGTCCCTCCCAAATCTGTGACTTCTCTAAT | |||||| |||| || | | | | | || || | γ 789 ACTGTCATTCGCAAAGGACC...CATTTCGATGACCAAGAACCCTTTGGG β 816 GATGAATAAAGATGGCTTCTTGGGAGGAATGTCAGTCAACACCGGCGAGG
| | | | | ||| ||| || | ||| || | ||||
γ 836 GCTCCCTTGCCAGAAGGACCTGGTGGGAGTGGTCATGAACCCCAGTGAGG β 866 TATTTTGCTCAGTCCCGGGCCGTTTATCTCTACTCAGTTCAACTTCAAAG
| || ||||| ||||| || | | || || ||||| || || || |||
γ 886 TCTTCTGCTCGGTCCCTGGAAGACTGTCCCTGCTCAGCTCCACGTCGAAG β 916 TACAAAGTCACTGTGGGCGAAGTTCAGAGAAGGCTCTCGCCCCCTGAATG
|||||||| ||||||| || || ||||| | || || || || |||||
γ 936 TACAAAGTAACTGTGGCTGAGGTACAGAGGCGACTGTCACCACCGGAATG <- Exon4 Exon5 ->
β 966 CCTCAATGCATCTCTCCTGGGCGGCGTCCTCAGAAGAGCCAAATCGAAAA ||| || || || |||||||| || || ||||||||||| || || ||||
γ 986 CCTAAACGCCTCGCTCCTGGGAGGTGTGCTCAGAAGAGCAAAGTGCAAAA β 1016 ATGGGGGGAGATCTTTGAGAGAAAGGCTAGAAAAAATCGGTTTGAATTTA
|||| || | || ||||| || | | | || ||||| || ||||| | γ 1036 ATGGAGGCCGGTCCTTGAGGGAGAAGTTGGACAAAATTGGATTGAACCTT β 1066 CCCGCGGGCAGGCGCAAAGCAGCAAATGTCACGTTACTCACCTCACTGGT
|| || || || || ||||| || | ||||| | ||||| || || ||
γ 1086 CCGGCCGGGAGACGGAAAGCTGCCCACGTCACTCTCCTCACGTCTCTCGT <- Exon 5 Exon 6 ->
β 1116 AGAAGGGGAAGCTGTTCACTTAGCTCGGGATTTCGGGTATATTTGTGAAA ||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||| ||| | || |||
γ 1136 GGAAGGTGAAGCCGTCCACCTAGCACGGGACTTCGCCTATGTCTGCGAAG
β 1166 CAGAGTTTCCTGCTAAAGCCGTGTCCGAGTATTTGAACAG...ACAGCAC | ||||| ||| |||||| ||| | || ||||| | || ||| | γ 1186 CTGAGTTCCCTAGTAAAGCGGTGGCTGACTATTTAACGAGACCACATCTT β 1213 ACGGACCCCAGTGACCTGCACTCCAGGAAGAATATGCTGCTGGCCACCAA
|| | | ||| || | | |||||| |||| || |||| | | γ 1236 GGGGGACGGAATGAGATGGCCACGCGGAAGAGTATGTTGTTGGCTGCACA
<- Exon 6 Exon 7 ->
β 1263 GCAACTTTGTAAAGAATTTACGGATCTGCTGGCTCAGGACAGGACACCGA ||| | || || || || || || || || ||| || ||||||| | γ 1286 GCAGGTGTGCAAGGAGTTCACTGACCTTCTCCATCAAGATCGGACACCCA β 1313 TCGGAAACAGCAGGCCCAGCCCCATCCTGGAGCCGGGCATCCAAAGCTGT
||| |||| ||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||
γ 1314 ACGGGAACAACAGGCCCGCCCAGGTCTTGGAGCCGAACATACAAAACTGT β 1363 CTCACGCACTTCAGTCTCATCACGCACGGCTTCGGTGCCCCGGCCATTTG
| | || ||||| || || || || ||||| || || |||||| ||
γ 1386 TTGTCTCATTTCAGCCTGATAACTCATGGCTTTGGCAGCCAGGCCATCTG β 1413 CGCTGCGCTCACGGCCCTGCAGAACTATCTCACCGAGGCGCTCAAAGGCA
|| ||| || | || ||||||| ||| ||| ||||| || | | ||
γ 1436 TGCGGCGGTCTCCGCAGTGCAGAATTATATCAAGGAGGCTCTAATCGCCA β 1463 TGGACAAGATGTTCTTGAAC...AACACCACT
| || ||| | | ||||| | |||
γ 1486 TCGATAAGTCCTACATGAACCCGGGGGACCAGAGTCCGGCTGATTCCAGC β 1492 AACAGGCACACGTCTGGGGAAGGCCCAGGTAGTAAAACTGGCGACAAGGA
|| | | | |||| | | | ||| |||| ||||||
γ 1536 AAGACGATGGAGAAAATGGAAAAGCACAGGAAGTAAAATGGCTGCAAGGA <- Exon 7
β 1442 GGAGAAACACAGGAAATGAAAAAAAAA...
|| | | | ||| | | |
γ 1586 GGCCAGAGAGCAGAAGGAGAGGACCCAGGCCCCTCCACTGGGGCAGCCCG
6.3 Restriktionskartierung der PCR-Fragmente des murinen
Restriktion Schnittstellen in mm in bpunverdaut / 11 1588 Größe der Marker- Fragmente in bp
Fragment B Restriktion Schnittstellen in mm in bp
unverdaut / 11 1588 Größe der Marker- Fragmente in bp
Fragment C
Laufwert des Größe der Marker-Fragment Marker-Fragments Marker-Fragmente
Nr. in mm in bp
1 3 3054
2 7 2036
3 9,5 1636
4 15,5 1018
5 23 506
6 25,5 396
7 26,5 344
8 28 298
9 30 220
Laufwert Größe der Restriktions- der Restriktions-Anzahl der Fragmente Fragmente Restriktion Schnittstellen in mm in bp
unverdaut / 21 644
BamHI 0 21 644
DraI 0 21 644
HindIII 0 21 644
PvuI 0 21 644
SacI 0 21 644
XhoI 0 21 644
ScaI 0 21 644
SalI 0 21 644
Eichkurve
Logarithmische Regression:
y = -1244,7Ln(x) + 4434
0 1000 2000 3000 4000
0 5 10 15 20 25 30 35
Lauwert in mm Größe der Marker- Fragmente in bp
Fragment D
Laufwert des Größe der Marker-Fragment Marker-Fragments Marker-Fragmente
Nr. in mm in bp
1 3 3054
2 8,5 2036
3 11,5 1636
4 18,5 1018
5 28 506
Laufwert Größe der Restriktions- der Restriktions-Anzahl der Fragmente Fragmente Restriktion Schnittstellen in mm in bp
unverdaut / 8 2001
BamHI 1 15 1281
24,5 719
DraI 0 8 2001
HindIII / keine DNA
PvuI 0 8 2001
SacI 1 11,5 1586
nicht sichtbar
XhoI 0 8,5 1932
ScaI 0 8 2001
SalI 0 8 2001
Eichkurve
Logarithmische Regression:
y = -1145,8Ln(x) + 4384,1
0 1000 2000 3000 4000
0 5 10 15 20 25 30
Lauwert in mm Größe der Marker- Fragmente in bp
Fragment E
Laufwert des Größe der Marker-Fragment Marker-Fragments Marker-Fragmente
Nr. in mm in bp
1 3 3054
2 7 2036
3 11 1636
4 19 1018
5 28 506
Laufwert Größe der Restriktions- der Restriktions-Anzahl der Fragmente Fragmente Restriktion Schnittstellen in mm in bp
unverdaut / 19 978
BamHI 1 21 866
36 263
DraI 0 19 978
HindIII / 19 978
PvuI 0 19 978
SacI 0 19 978
XhoI 0 19 978
ScaI 0 19 978
SalI 0 19 978
Eichkurve
Logarithmische Regression:
y = -1119,2Ln(x) + 4273,2
0 1000 2000 3000 4000
0 5 10 15 20 25 30
Lauwert in mm Größe der Marker- Fragmente in bp
Fragment F Restriktion Schnittstellen in mm in bp
unverdaut / 7 2095 Größe der Marker- Fragmente in bp
Fragment G Restriktion Schnittstellen in mm in bp
unverdaut / 11 1449 Größe der Marker- Fragmente in bp
Fragment H
Laufwert des Größe der Marker-Fragment Marker-Fragments Marker-Fragmente
Nr. in mm in bp
1 3 3054
2 8,5 2036
3 11 1636
4 18 1018
5 27 506
Laufwert Größe der Restriktions- der Restriktions-Anzahl der Fragmente Fragmente Restriktion Schnittstellen in mm in bp
unverdaut / 5 2530
BamHI 1 14,25 1309
14,75 1269
DraI 0 5 2530
HindIII 1 9 1845
24 701
PvuI 0 5 2530
SacI 1 11,25 1585
19,75 929
XhoI 1 5,5 2419
nicht sichtbar
ScaI 0 5 2530
SalI 0 5 2530
Eichkurve
Logarithmische Regression:
y = -1166Ln(x) + 4407
0 1000 2000 3000 4000
0 5 10 15 20 25 30
Lauwert in mm Größe der Marker- Fragmente in bp
Fragment I
Laufwert des Größe der Marker-Fragment Marker-Fragments Marker-Fragmente
Nr. in mm in bp
1 3 3054
2 8,5 2036
3 11,5 1636
4 18,5 1018
5 28 506
Laufwert Größe der Restriktions- der Restriktions-Anzahl der Fragmente Fragmente Restriktion Schnittstellen in mm in bp
unverdaut / 8 2001
BamHI 0 8 2001
DraI 1 17,5 1105
22 842
HindIII 0 8 2001
PvuI 0 8 2001
SacI 1 16 1207
20 952
XhoI 0 8 2001
ScaI 0 8 2001
SalI 0 8 2001
Eichkurve
Logarithmische Regression:
y = -1145,8Ln(x) + 4384,1
0 1000 2000 3000 4000
0 5 10 15 20 25 30
Lauwert in mm Größe der Marker- Fragmente in bp
6.4 Partielle Intron-Sequenzen des murinen AP-2γ-Gens
Intron-Sequenz S1
1 GGGAGGAGTT ATGATAATTT CCTTCCCATT AAGGCGTTCG GGTCGTATCG CCGGGACACA CTGTGAGGGT GAGGCTTCTC CGGTCCACGC TGCGGCCTCT 100 101 ACACACCCAC GGCCACCACA TCTCTGTGCA CAGCCACCGA TGCGCTCCAG TGACTGGGAC AGCAAGGCCG GCGCGCGCGG CGGGGGCGGC GCAGACGCCT 200 201 GGCCACCGTG ACCCCGATTG TGGATTTACC GCTCGGGGGG TGGGGGGAGC CTGGATTTAA CTGGCGACTA TTTTGGGGGA CGCCGGACGC C 291
Intron-Sequenz S2
1 GAGGTCGCCG CACGCCAGGC CCTGGGGCAC GGGTAACCGG ACTGTCGGGG AACGCGCTCT TGGCACCTCC AAGCGACGCA GCGCGGGAAC CTTCGCCAGA 100 101 GGGCTCGAAG GATTCGTCCC CTCAGGTCTT AGACCGATAG GCTCACAACG AAGTCCGGGG AGCTCATTGT CCCCGGGGGC TCTCGGGCTC TGGGGCGGAT 200 201 CGAGACGGGT GGTGCGAGCT TGGTGGGGCG CATAGGTGCC CCTCTCCTGG CTTGCTTGTT CGCTGTAGCA GGGTTTCGTA CTAACCGGGT CTCTCCTGTT 300 301 TCTCTCCCA 309
Intron-Sequenz S3
1 GTGAGCAGCG GGGGGGAGGC TGGGGGTGGG ATGGGGGTTC TACCTTACCC TCCAGCCTTT CCACCTTCCT CCAAACTTAA AAGAAATTGT CATTTCCCCC 100 101 C 101
Intron-Sequenz S4
1 GTAAACACTG ACTCTTTCCG CTTGTGTCTT AACACGTGGC TCTGACCAGT GAAGTTGCCC CTTTTCTGCA AAGGCTGGGG TATTAAGTGG CCAACACGGC 100 101 TCACGTAGTG GAGAAGACCA CGCTTGAACG AAAGTCAGTT CCTGGCCTGA ACGAAAAGAA CTCTCAGGAG CTGTGATTTT TAAAAGATTG GGTTTTTTTG 200 201 TTGTTGTTGT TGTTTTTTGG AGTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTGTTA GTGGCCATAT TTTTTTGAAT CAAATGTTTC AGTCTGTAAC TCAGAGTGGC 300 301 CTTGAATTCC TTGTAAGCCT CCTGGCTCAA CCTCCCTAGT CGTGGCATTA CAGGTGGGAA ATACAATTTA ACTTAAAAAC GGGGTGGGGG TGGGGTGGGA 400 401 GATCAGAATA GTACCTT 417
Intron-Sequenz S5
1 ATAGTCAATA CAGGTTACAT GTTTGAGGAA TGATCTGTAA TTACAGCAGT TATGTTCTTG AGATTGTCGA GCTATTAGTG GATTGGAGAG GTTGGAGAGG 100 101 AAACTGAAAG GAAACAGTTT CTGAGTAGAC TAAGCAGATC TGGCTAATCT GTATTTCTGA ATTCCTGGTG TCAGCTCGAC TGAAGGTCTG GCGATGATCT 200 201 CCCGTGGCTT CAGTTCATCT TGGAGGGGAG GGGAGGATGC CGTTTATTTC GTATTGAAGC GGTTTTTCTG AAAGCAAATG CTTTAATTAA ACAGATTACC 300 301 ATGGTGGCCT GGAACAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGGGAGA GGGAGGGAGG AGAGAGAGAA ACAACTCTTC ATGGAATCTT AACTAATTAA GGTCTGGAGG 400 401 TGTTAACTCA TGATTCCAGA CTCCAGTCTT TCAAGAAAGG ATACGGCTTT TAAAAGGACT TGCAAGAAGC AAGGAGTTTT CTGGAGGCAG ACCTCAGCTT 500 501 TGGTTTGCCC TTTTGTAAAG GTCTCTCTGC CCCATCCGTT TCTAATGGCG AACCTATTCT GTCCCCTAC 569
Intron-Sequenz S6
1 GTGACACTTG TTCAGGGCCC CCTGGGTTGG GTAGTTGAAG GTGACTATGT ACGAGGGCCT GGAGGTATTT TTAACATTTA TGTAACTTTT ATATCTTAAC 100 101 GCTGAATTCT AATCTGTGTT AAGAGAGCTT TTTAGTGCGT ATCTTCTTCT TGAAAGTGCC AAATGCAGAA TGTGCTAAAA CAGCAGTAAC AGGTTATCAT 200 201 TTGGTTGGGA TTAAGAGGCA GCAGCTGCAT GGAGGGGGGG GGCTTCTAGT GTTTGGTCCC CCCAGGGAGT TTACTGCTGC AGTCATGAGT GAAGATTTTT 300 301 CTGCACCCCT ACTAGAGGAT TCTGAGATTG GTGGGGGTGG GGGTCTGGTT TGTTTGTTTG TTCGTTTGAT TGTTTTGCAA GTCGCTAACT TTCCCTCTCC 400 401 ATGCAG 406
Intron-Sequenz S7
1 CCGTGCGGTT TGTCACTCAG AAAGCCATGT TACCAAAGCT TTCACTTTTC TGGACCTATG AGGTCACGCG GGAGTTGGCA AAACTTTCCC ATGACGTGAG 100 101 CTAGCTTTTG AAAGATTCGG TCCATCAAGG ATGGGCCCGG CCATGAGGAG GCAGAATGGC CATTTTTCTG GTTGTGGGGT ATCTGGTTGT GTTCGTTGTA 200 201 CACAATGGGC ACTGGCTTAG TTCACCATTT CTTCCCTTCC ATCAAAGGCC GGCGGTGGGT GGGGGGAAAT GAAACCCATG GTCCACAAAT GAGCTCCTTC 300 301 TCCAATCCTG AGGGCGTACG TGTGTCAGTC CATTTTAATG GGACCGTCCC AGTCTGAAGT AC 362
Intron-Sequenz S8
1 TGAGATATTT GCTCTCTACA GTCCCTGGGG CTCCAAACCC GGAAGCTACT GTGGTGGGCG ACGGCAGAGC TTTGCAGCGT CTTTCGTCCT TCGCAGCAAC 100 101 CTCTAGTAGT GTTTAGAGGA GGGCATTGCT CCATCCCAGG TGGCGAGGGG CCTGCTAACA CCACTCACAG CAGGCACAGC CCCTGTTTAT TGCCTTTGGG 200 201 TATGTGTAAG AATTTGTGTA GCTCAGTTAG TAGGGTTTGC CTAGTATCGA TGAAACTAGG CAACATCCTC AGCTACACAT AAAGCCAAGC ATGGTGGTAT 300 301 ATGCCTGTAA CGCCACGATT CGAGACGAAG ACTGAGTCGA TCATCTCAGC TACAAGTAGT CAGCACTGCT CAATAATGTC TCATGACTAC GAGTACGGCT 400 401 CACCACA 407
Intron-Sequenz S9
1 GCTGGCATAC ATGTAAGCAC CAGATTTGGT CCTTAGTGCT GCATAAATCA AGAGTAGAGG TGAATACTGT TGTGATCTTG TATGGGGAGG TAGAGGCAGT 100 101 AATAAAACCA AGGTCATTCT TGGGTATATA GTAAATTTGA GGCCCATTTG GAGACTGTCT CAGAAGTGAA TGTAAATTCT CCTTTCTGAG CCTGCCTATC 200 201 CTAATAGGAT CCGGGGTGGG GGTAGGGGTG GGGGTGGGAG TGGGGGTGGG GGTAGGGGTT TATTCGGTCA AGAGCTGAGT AACAGTCACC AACTGTGTTC 300 301 ACAGG 305
Intron-Sequenz S10
1 GAGGACCCAG GCCCCTCCAC TGGGGCAGCC CGGGAAGTGT CCAGAGCAGC AGCAGCAGCA GCAGCAGGGA AGCAGTTACA ACCCGCCCGC CCACACCACA 100 101 CTCTGGACCT GCCCTCTTGG AGTCTTTGTG ACTTTTCCAT TTAACCCTGG ACATGCTATC CTGAAGCCAC TTGGTTTGGT TCTTTTATTC ATTAAACATG 200 201 TGTGTTTTTT TTTTTTAAAT CCGTTCCCTC TCTTGAAAGG TGCTACGAGT TTTAGAACCC TTTGTAAGAA CTCCCTGGGC AGACAAGAAA CTCCACGCTT 300 301 AGCTGCTAAC ACAGCAGGTC GATGGGAGTC GTCAGATAAA GGGATCGATC
AATCATAACT TATTTCTTTT CAGTGTTAAG ATAATAGCTG GCTTTATGTC 400 401 CACTAAATAT TATCTAAAAA AATAGTATTA TCTAGTTTCC ACACTTGTCA TCACACTTCT GTAGAGCAAT CAAATGCCTT ACAGCACTAC TACATGTATT 500 501 AA 502