Dorothy Crawfoot Hodgkin
(1910 – 1994)
R = 5‘‐Desoxyadenosyl (Coenzym B12)
R = CN (Cyanocobalamin: Vitamin B ) l k l k d
R = CN (Cyanocobalamin: Vitamin B12)
R = Me (Methylcobalamin) Molekülstruktur des Coenzym B12
(P. G. Lenhert, 1968)
Porphyrin 16‐gliedrig
zweibasig
Corrin 15‐gliedrig
einbasig
zweibasig einbasig
planar
mit kleinen Metallionen Sattelkonformation
h l l h
mit kleinen Metallionen chirale Zentren möglich
EPR‐Spektroskopie
axiales Spektrum
59
Co: 100 %, I = 7/2 Oktett durch
H f i k l Hyperfeinkopplung
N Co N
N N
N N
N
14
N: 99.63 %, I = 1 Triplett durch
Superhyperfeinkopplung ein einzelnes
Stickstoffatom als Kopplungspartner
J. Rétey et al., Angew. Chem. 1998, 110, 643.
Frage:
base‐on/base‐off ‐Form
15
N: I = 1/2 Dublett durch
J. Rétey et al., Angew. Chem. 1998, 110, 643.
Superhyperfeinkopplung
B1212‐Bindungsdomäne der Methionin‐Synthase mit Methylcobalamin‐Funktiong y y
Substitution des Benzimidazols am Cobalt,
separate Fixierung des
HN O N
Imidazol‐N‐Koordination in apicaler Position durch Histidin aus dem Protein:
Verbindung Coenzym + Apoenzym
separate Fixierung des
Benzimidazol‐Zuckerphosphatrestes zwischen –Helices und ‐Faltblättern
H: Histidin
CH2 NH
C
C NH H
HN
Methylgruppe am Cobalt
hydrophober Deckel:
NH C C HN
O H
y g pp
Abschirmung der Methylgruppe gegen das Lösungsmittel
F: Phenylalanin CH2 Ph
O
Acetamid‐Seitengruppen in H‐Brückenbindungsposition
F: Phenylalanin
zur Protein‐Rückgrat
C O O
O
- H O
CH2 NH
C C CH2 H O
C O
HN C
C NH H
S: Serin D: Aspartat
HN
Fixierung von Helix Faltblatt in Domäne II
M. L. Ludwig et al., Science1994, 266,1669.
Fixierung von ‐Helix‐‐Faltblatt in Domäne II
„Festkneifen“ des Phosphatzuckerrests
Phosphatzucker‐Einheit passend zwischen
N C C HN H
passend zwischen Glycinreste
„gesteckt“
G: Glycin H NH C C
O
H‐Brücken‐Wechselwirkung
HN
H g
zwischen Serin und dem N3‐Atom
des Benzimidazol‐Derivats,
(genau dieses N‐Atom koordiniert
CH2 OH NH C C
O
(g
im Coenzym an das Cobalt)
S: Serin
M. L. Ludwig et al., Science1994, 266,1669.
Modellverbindungen
Supernukleophil Co(I) wenig beständig
Thermodynamik und Kinetik
Radikalfänger
R. G. Finke, B. P. Hay, Inorg. Chem. 1984, 23, 3034.
G
‡exp(37°C) = 29.7 kcal/mol k
1≈ 10
–7s
–1Enzym: Cofaktor + Apoenzym
k 10
2 –1G
‡(37°C) 15 k l/ l
R. G. Finke, B. P. Hay, Inorg. Chem. 1984, 23, 3034.