Ubungen Molekulare Phylogenie ¨ Wintersemester 2006/07

Bestimmen Sie f¨ ur diese drei Sequenzpaare jeweils die beobachtete Anzahl der Substitutionen und Abgabe: 13.12.06.. die gesch¨ atzte Anzahl der tats¨ achlich

Aufgabe 10.1 Wir modellieren Sequenzen der L¨ange L ¨ uber einem festen Alpha- bet der Gr¨oße D mit einem inhomogenen Markov Modell 1-ter Ordnung. Als Daten stehen uns N Sequenzen

Wir nehmen an, daß diese Bande einen gewissen Anteil an funktionalen und nicht- funktionalen Sequenzen enth¨ alt, wobei die funktionalen Sequenzen auf Grund Ihrer Funktionalit¨ at

Leiten Sie weiterhin den Erwartungs- wertvektor und die Kovarianzmatrix eines polynomialverteilten Zufallsvektors her und beweisen Sie, dass die Randverteilung

Welche der beiden Verteilungen scheint Ihnen rein visuell (f¨ ur diesen Datensatz) geeigneter.

Falls nicht, geben Sie einen er- wartungstreuen Sch¨ atzer von µ und σ 2 an und berechnen Sie diesen sowie die dazugeh¨ orige Log-Likelihood.. Vergleichen Sie die vier Sch¨

Aufgabe 10.2 Sie gehen ohne Misstrauen in eine Spielh¨ olle, in der mit einer M¨ unze gespielt wird: Der Spieler oder die Spielerin setzt gegen den “Direktor” des Etablis-

Aufgabe 12.1 Der Datensatz sigma70.txt auf der Homepage zur Vorlesung besteht aus 238 Sigma-70 Bindungsstellen der L¨ ange 12.?. a) Modellieren Sie eine Sigma-70 Bindungsstelle