7 Anhang
7.2 Putative Bindepartner von FLAG-TIA1vI
ANHANG
142
ANHANG
143
Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q HNRPQ/SYNCRIP GI: 92090361 2 0 0 0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U HNRPU/HNRNPU GI: 254763463 0 7 0 4 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein
U-like protein 1 HNRL1/HNRNPUL1 GI: 90101344 3 0 0 0
Histone H4 H4/HIST1H4A GI: 51317339 0 3 0 0
Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding
protein 1 IF2B1/IGF2BP1 GI: 296434536 18 8 16 14
Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding
protein 2 IF2B2/IGF2BP2 GI: 224471831 3 0 5 0
Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding
protein 3 IF2B3/IGF2BP3 GI: 254763311 6 0 3 0
Keratin, type I cytoskeletal 10 K1C10/KRT10 GI: 269849769 17 15 19 18 Keratin, type I cytoskeletal 14 K1C14/KRT14 GI: 229463044 2 4 7 6
Keratin, type I cytoskeletal 16 K1C16/KRT16 GI: 23503075 0 2 6 5
Keratin, type I cytoskeletal 9 K1C9/KRT9 GI: 239938886 7 14 19 16
Keratin, type II cytoskeletal 1 K2C1/KRT1 GI: 238054406 14 18 29 24 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal K22E/KRT2 GI: 239938650 9 10 19 13
Keratin, type II cytoskeletal 5 K2C5/KRT5 GI: 143811411 1 3 7 3
Keratin, type II cytoskeletal 6A K2C6A/KRT6A GI: 1346344 0 1 5 2
Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic SYLC/LARS GI: 48428689 0 1 0 2
Matrin-3 MATR3 GI: 12643409 3 0 0 0
Methylosome protein 50 MEP50/WDR77 GI: 32171507 1 1 3 6
Non-POU domain-containing octamer-binding
protein NONO GI: 67469924 0 1 0 9
Nucleolysin TIA-1 Isoform p40 TIA1 GI: 206729905 18 21 13 17
O-phosphoseryl-tRNA(Sec) selenium
transferase SPCS/SEPSECS GI: 62287911 12 0 0 0
Peroxisomal multifunctional enzyme type 2 DHB4/HSD17B4 GI: 1706396 0 11 0 11
Poly [ADP-ribose] polymerase 1 PARP1 GI: 130781 0 3 0 4
Polyadenylate-binding protein 1 PABP1/PABPC1 GI: 3183544 20 7 3 12
Polyadenylate-binding protein 4 PABP4/PABPC4 GI: 12229875 6 2 1 6
Polypyrimidine tract-binding protein 1 PTBP1 GI: 131528 2 0 0 0
Prelamin-A/C LMNA GI: 125962 0 0 0 2
Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 DDX5 GI: 129383 3 1 0 1 Protein arginine N-methyltransferase 5 ANM5/PRMT5 GI: 32171585 4 12 4 23
Protein S100-A7 GN=S100A7 S10A7/S100A7 GI: 172046820 0 2 0 0
Protein S100-A9 S10A9/S100A9 GI: 115444 0 3 0 0
Putative helicase MOV-10 MOV10 GI: 24638063 3 0 0 0
Ras GTPase-activating protein-binding
protein 1 G3BP1 GI: 14916572 0 0 0 3
Regulator of nonsense transcripts 1 RENT1/UPF1 GI: 17380291 14 0 0 0
RNA-binding protein 10 RBM10 GI: 218512116 0 0 0 2
RuvB-like 2 RUVB2/RUVBL2 GI: 28201890 0 0 0 2
Serine/threonine-protein kinase 38 STK38 GI: 56749457 1 0 0 2
Signal recognition particle 54 kDa protein SRP54 GI: 46577650 0 2 0 2
Splicing factor 3A subunit 1 SF3A1 GI: 2498882 1 0 0 2
Splicing factor 3B subunit 1 SF3B1 GI: 269849656 1 1 1 5
Splicing factor 3B subunit 3 SF3B3 GI: 116242787 3 2 0 4
Splicing factor, proline- and glutamine-rich SFPQ GI: 1709851 0 10 0 6
ANHANG
144
Staphylococcal nuclease domain-containing
protein 1 SND1 GI: 60415926 0 15 0 19
Stress-70 protein, mitochondrial GRP75/HSPA9 GI: 21264428 0 6 2 11
T-complex protein 1 subunit theta TCPQ/CCT8 GI: 9988062 0 1 0 2
Transcription intermediary factor 1-beta TIF1B/TRIM28 GI: 3183179 0 2 0 1 tRNA-splicing ligase RtcB homolog RTCB/ C22orf28 GI: 74753486 0 0 0 3
Tubulin alpha-1A chain TBA1A/TUBA1A GI: 55977864 3 4 5 4
Tubulin beta chain TBB5/TUBB GI: 56757569 0 7 4 10
Tubulin beta-2A chain TBB2A/ TUBB2A GI: 75075976 4 1 0 1
Tyrosine-protein kinase JAK1 JAK1 GI: 215274013 0 0 1 3
Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10 UBP10/USP10 GI: 2501458 0 6 0 7 Ubiquitin-associated protein 2-like UBP2L/UBAP2L GI: 109940042 0 0 0 2
Unconventional myosin-Ib MYO1B GI: 68583739 0 1 0 2
Unconventional myosin-VI MYO6 GI: 122065628 0 0 0 3
Valine--tRNA ligase SYVC/VARS GI: 12644177 0 7 0 10
Vigilin VIGLN/HDLBP GI: 218511884 0 1 0 6
X-ray repair cross-complementing protein 5 XRCC5 GI: 125731 1 3 0 0 (-) ohne RNase-Behandlung, (+) mit RNase-Behandlung
Tab. 9: putative FLAG-TIA1vI-Bindepartner
Protein NCBI-Nummer
MEP50 (methylosome protein 50) GI:32171507
NONO (non-POU domain-containing octamer-binding protein) GI:67469924
Hsp70 (heat shock cognate 71 protein) GI:123648
JAK1 (tyrosine-protein kinase, Janus Kinase 1) GI:215274013 hnRNP Q (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q) GI:92090361
PAPB1 (polyadenylate binding-protein 1) GI:3183544
RO60 (60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein) GI:52788235
S10A9 (protein S100 calcium-binding protein-A9) GI:115444
MATR3 (Matrin-3) GI:12643409
MOV10 (moloney leukemia virus 10 protein) GI:24638063 hnRNP L (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L) GI:215274006 hnRNP M (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M) GI:55977747 hnRNP K (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K) GI:48429103 STK38 (Serin-/Threonine-protein kinase 38) GI:56749457
RBM10 (RNA-binding protein 10) GI:218512116
SFPQ (splicing factor, proline- and glutamine rich) GI:1709851
GRP78 (78 kDa glucose-regulated protein) GI:14916999
IGF2BP1 (insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein1) GI:296434536 STAU1 (double- stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1) GI:90185286 ANM5 (protein arginine N-methyltransferase 5) GI:32171585
PUBLIKATIONSLISTE
145
Publikationsliste
Tagungsbeiträge-Vorträge
E.Winkler, R. Geissler, H. Aurich, A. Mensch, N. Stöhr, S. Friedrich, S. Hüttelmaier, S.-E.
Behrens: Hepatitis C Virus replication induces expression of vascular endothelial growth factor by different mechanisms and accelerates vascularization of human hepatoma, 22. Jahrestagung der Gesellschaft für Virologie, 14.-17.03.2012, Essen.
E.Winkler, R. Geissler, H. Aurich, A. Mensch, N. Stöhr, S. Friedrich, S. Hüttelmaier, S.-E.
Behrens: Hepatitis C Virus replication induces expression of vascular endothelial growth factor and accelerates vascularization of human hepatoma, First international meeting-Posttranscriptional Control of Gene Expression-Mechanism and Role in Pathogenesis, 15.-17.03.2012, Halle.
Tagungsbeiträge-Poster
E.Winkler, H. Aurich, R. Geissler, A. Mensch, N. Stöhr, S. Friedrich, S. Hüttelmaier, S.-E.
Behrens: Hepatitis C Virus replication induces expression of vascular endothelial growth factor and accelerates vascularization of human hepatoma, 18th Inter-national Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses”, 08.-12.09.2011, Seattle, Washington, USA
DANKSAGUNG
146
Danksagung
Ich möchte mich bei allen Personen bedanken, die mich während der Anfertigung meiner Doktorarbeit unterstützt haben und somit zum Gelingen beitrugen.
Mein besonderer Dank gilt Herrn Prof. Dr. Sven-Erik Behrens für die Möglichkeit in seiner Arbeitsgruppe dieses Thema zu bearbeiten. Mit seinem stetigen Interesse und kritischen Diskussionen sowie seinem Vertrauen war er maßgeblich am Entstehen dieser Doktorarbeit beteiligt.
Zudem danke ich ihm sowie Herrn Prof. Dr. Stefan Hüttelmaier und Prof. Dr. Norbert Tautz für die freundliche Übernahme der Gutachten.
Bei PD Dr. habil. Ralph Peter Golbik möchte ich mich für die stete Hilfsbereitschaft bedanken. Außerdem danke ich ihm und Aniseh Poshtgohian Madi für die Reinigung des TIA1-Proteins. Für die exzellenten Arbeitsbedingungen in der Zellkultur und moralischer Unterstützung bedanke ich mich bei Christine Hamann
Mein spezieller Dank gilt Dr. Anika Penzel, Dr. Jana Schuck und Dr. Torsten Gursinsky für die vielen motivierenden Diskussionen, ihre stete Hilfsbereitschaft und die angenehme Zusammenarbeit sowie Arbeitsatmosphäre.
Dr. René Geißler und Dipl.-Biochemiker Paul Knick sowie Dr. Susann Friedrich danke ich für die Zurverfügungstellung von Plasmiden und gereinigten Proteinen, sowie für konstruktive Gespräche im Laboralltag. Dr. Martina Behrens danke ich für die Bereitstellung des MVA-T7-Virus. Bei Dr. Thomas Ruppert, vom Zentrum für molekulare Biologie der Universität Heidelberg, sowie bei Dr. Angelika Schierhorn, vom Institut für Biochemie und Biotechnologie der Universität Halle-Wittenberg, bedanke ich mich für die Durchführung der massenspektrometrischen Analysen. Weiterhin möchte ich mich bei Prof. Dr. Stefan Hüttelmaier, Dr. Nadine Stöhr und Herrn Dr. Hendryk Aurich bedanken, die durch anregende wissenschaftliche Gespräche zu dieser Arbeit beigetragen haben.
Bei allen derzeitigen und ehemaligen Mitgliedern der Abteilung Mikrobielle Biotechnologie bedanke ich mich für ein freundliches und angenehmes Arbeitsklima sowie die stets gute Zusammenarbeit.
Mein größtes Dankeschön gilt meiner Familie, meinen Eltern und meinem Freund. Ihnen danke ich für die Liebe, die ständige Unterstützung in allen Lebenslagen und dass sie unentwegt an mich geglaubt haben.
LEBENSLAUF
147
Lebenslauf
Persönliche Daten
Name Eileen-Christin Winkler Geburtsdatum 31. Mai 1984
Geburtsort Leipzig Geschlecht weiblich Staatsangehörigkeit deutsch Ausbildung
10/2004-09/2009 Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
Diplomstudium der Biologie mit Abschluss: Diplom-Biologe Diplomarbeit: Einfluss der Hepatitis-C-Virus Replikation auf zelluläre Genexpression
08/2002 - 07/2004 Thomas-Müntzer/Trotha-Gymnasium Halle (Saale) Abschluss: Allgemeine Hochschulreife
08/2001 - 05/2002 Theodore F. Riggs Senior High School, Pierre, SD, USA Abschluss: High School Diploma
08/1995 - 06/2001 Thomas-Müntzer/Trotha-Gymnasium Halle (Saale) 08/1991 - 07/1995 Grundschule Kröllwitz Halle (Saale)
Arbeitserfahrung
seit 02/2015 Mitarbeiterin bei Visufarma GmbH
10/2009 – 12/2013 Wissenschaftlicher Mitarbeiter am Institut für Biochemie und Biotechnologie, Abteilung Mikrobielle Biotechnologie
Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
Thema: Einfluss der RNA-Replikation des Hepatitis-C-Virus auf die Expression des vascular endothelial growth factor A
Betreuer: Prof. Dr. Sven-Erik Behrens
07/2007 - 10/2007 Studentische Hilfskraft, Abteilung Allgemeine Genetik Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg
06/2005 - 09/2005 Studentische Hilfskraft am Umweltforschungszentrum 11/2004 – 12/2004 Leipzig/Halle, Abteilung Isotopenhydrologie
Oberursel, den 20.12.2017
………..
Eileen-Christin Winkler