• Keine Ergebnisse gefunden

No potential conflicts of interest were disclosed. Financial support was provided as follows: BMBF: NGFNPlus (#01GS0896, F. Westermann) , European Union (EU, FP6): E.E.T. Pipeline (#037260, S. Gogolin, F. Westermann), EU (FP7): ASSET (S.

Gogolin, F. Westermann), BMBF: NGFNPlus ENGINE (N. Harder, R. Batra, N. Diessl, R. König), FANCI SysTec (N. Harder), Helmholtz Alliance on Systems Biology (SB Cancer, D.141100/07.997, N. Harder, R. Batra, N. Diessl, R. König).

high MYCN

81 Manuskript II

3.8 References

[1] B.A. Weaver, D.W. Cleveland, Does aneuploidy cause cancer?, Current opinion in cell  biology 18 (2006) 658‐667 

 

[2] R. Spitz, B. Hero, T. Simon, F. Berthold, Loss in chromosome 11q identifies tumors with  increased risk for metastatic relapses in localized and 4S neuroblastoma, Clin Cancer  Res 12 (2006) 3368‐3373 

 

[3] E.F. Attiyeh, W.B. London, Y.P. Mosse, Q. Wang, C. Winter, D. Khazi, P.W. McGrady, R.C. 

Seeger, A.T. Look, H. Shimada, G.M. Brodeur, S.L. Cohn, K.K. Matthay, J.M. Maris,  Chromosome 1p and 11q deletions and outcome in neuroblastoma, The New England 

[5] R.C. Seeger, G.M. Brodeur, H. Sather, A. Dalton, S.E. Siegel, K.Y. Wong, D. Hammond,  Association of multiple copies of the N‐myc oncogene with rapid progression of  neuroblastomas, The New England journal of medicine 313 (1985) 1111‐1116 

 

[6] R. Ladenstein, I.M. Ambros, U. Potschger, G. Amann, C. Urban, F.M. Fink, K. Schmitt, R. 

Jones,  M.  Slociak,  F.  Schilling,  J.  Ritter,  F.  Berthold,  H.  Gadner,  P.F.  Ambros,  Prognostic  significance  of  DNA  di‐tetraploidy  in  neuroblastoma,  Medical  and  pediatric oncology 36 (2001) 83‐92 

 

[7] R. Bagatell, P. Rumcheva, W.B. London, S.L. Cohn, A.T. Look, G.M. Brodeur, C. Frantz, V. 

Joshi, P. Thorner, P.V. Rao, R. Castleberry, L.C. Bowman, Outcomes of children with  intermediate‐risk  neuroblastoma  after  treatment  stratified  by  MYCN  status  and  tumor cell ploidy, J Clin Oncol 23 (2005) 8819‐8827 

 

[8] R.E. George, W.B. London, S.L. Cohn, J.M. Maris, C. Kretschmar, L. Diller, G.M. Brodeur,  R.P.  Castleberry,  A.T.  Look,  Hyperdiploidy  plus  nonamplified  MYCN  confers  a  favorable  prognosis  in  children  12  to  18  months  old  with  disseminated  neuroblastoma: a Pediatric Oncology Group study, J Clin Oncol 23 (2005) 6466‐6473   

[9] J. Schneiderman, W.B. London, G.M. Brodeur, R.P. Castleberry, A.T. Look, S.L. Cohn,  Clinical  significance  of  MYCN  amplification  and  ploidy  in  favorable‐stage  neuroblastoma: a report from the Children's Oncology Group, J Clin Oncol 26 (2008) 

[11] F. Westermann, M. Schwab, Genetic parameters of neuroblastomas, Cancer letters 184  (2002) 127‐147 

 

[12] N.J. Ganem, Z. Storchova, D. Pellman, Tetraploidy, aneuploidy and cancer, Current  opinion in genetics & development 17 (2007) 157‐162 

 

[13] Z. Storchova, D. Pellman, From polyploidy to aneuploidy, genome instability and cancer,  Nature reviews 5 (2004) 45‐54 

 

[14] T. Fujiwara, M. Bandi, M. Nitta, E.V. Ivanova, R.T. Bronson, D. Pellman, Cytokinesis  failure generating tetraploids promotes tumorigenesis in p53‐null cells, Nature 437  (2005) 1043‐1047 

 

[15] M.T. Barrett, D. Pritchard, C. Palanca‐Wessels, J. Anderson, B.J. Reid, P.S. Rabinovitch,  Molecular phenotype of spontaneously arising 4N (G2‐tetraploid) intermediates of  neoplastic progression in Barrett's esophagus, Cancer research 63 (2003) 4211‐4217   

[16] A.J. Olaharski, R. Sotelo, G. Solorza‐Luna, M.E. Gonsebatt, P. Guzman, A. Mohar, D.A. 

Eastmond, Tetraploidy and chromosomal instability are early events during cervical  carcinogenesis, Carcinogenesis 27 (2006) 337‐343 

 

[17] Z. Storchova, C. Kuffer, The consequences of tetraploidy and aneuploidy, Journal of cell  science 121 (2008) 3859‐3866 

 

[18] R. Sotillo, E. Hernando, E. Diaz‐Rodriguez, J. Teruya‐Feldstein, C. Cordon‐Cardo, S.W. 

Lowe, R. Benezra, Mad2 overexpression promotes aneuploidy and tumorigenesis in  mice, Cancer cell 11 (2007) 9‐23 

 

[19] C.L. Rieder, H. Maiato, Stuck in division or passing through: what happens when cells  cannot satisfy the spindle assembly checkpoint, Developmental cell 7 (2004) 637‐651  V.  Mittal,  W.  Gerald,  R.  Benezra,  S.W.  Lowe,  C.  Cordon‐Cardo,  Rb  inactivation  promotes  genomic  instability  by  uncoupling  cell cycle  progression from  mitotic  control, Nature 430 (2004) 797‐802 

 

[23] M. Malumbres, Oncogene‐induced mitotic stress: p53 and pRb get mad too, Cancer cell  19 (2011) 691‐692 

83 Manuskript II

[24] J. Carr‐Wilkinson, K. O'Toole, K.M. Wood, C.C. Challen, A.G. Baker, J.R. Board, L. Evans,  M. Cole, N.K. Cheung, J. Boos, G. Kohler, I. Leuschner, A.D. Pearson, J. Lunec, D.A. 

Tweddle, High Frequency of p53/MDM2/p14ARF Pathway Abnormalities in Relapsed  Neuroblastoma, Clin Cancer Res 16 (2010) 1108‐1118 

 

[25] J.J. Molenaar, M.E. Ebus, J. Koster, P. van Sluis, C.J. van Noesel, R. Versteeg, H.N. Caron,  Cyclin  D1  and  CDK4  activity  contribute  to  the  undifferentiated  phenotype  in  neuroblastoma, Cancer research 68 (2008) 2599‐2609 

 

[26] J.J. Molenaar, P. van Sluis, K. Boon, R. Versteeg, H.N. Caron, Rearrangements and  increased expression of cyclin D1 (CCND1) in neuroblastoma, Genes, chromosomes & 

[28] F. Westermann, D. Muth, A. Benner, T. Bauer, K.O. Henrich, A. Oberthuer, B. Brors, T. 

Beissbarth, J. Vandesompele, F. Pattyn, B. Hero, R. Konig, M. Fischer, M. Schwab,  Distinct  transcriptional  MYCN/c‐MYC  activities  are  associated  with  spontaneous  regression or malignant progression in neuroblastomas, Genome biology 9 (2008)  R150 

 

[29] I. Eckerle, D. Muth, J. Batzler, K.O. Henrich, W. Lutz, M. Fischer, O. Witt, M. Schwab, F. 

Westermann, Regulation of BIRC5 and its isoform BIRC5‐2B in neuroblastoma, Cancer  letters 285 (2009) 99‐107 

 

[30] J.  Seoane,  H.V.  Le, J.  Massague, Myc suppression of  the  p21(Cip1) Cdk inhibitor  influences the outcome of the p53 response to DNA damage, Nature 419 (2002) 729‐

734   

[31] P.C. Galipeau, D.S. Cowan, C.A. Sanchez, M.T. Barrett, M.J. Emond, D.S. Levine, P.S. 

Rabinovitch, B.J. Reid, 17p (p53) allelic losses, 4N (G2/tetraploid) populations, and  progression  to  aneuploidy  in  Barrett's  esophagus,  Proceedings  of  the  National  Academy of Sciences of the United States of America 93 (1996) 7081‐7084 

 

[32] D.T. Jones, N. Jager, M. Kool, T. Zichner, B. Hutter, M. Sultan, Y.J. Cho, T.J. Pugh, V. 

Hovestadt, A.M. Stutz, T. Rausch, H.J. Warnatz, M. Ryzhova, S. Bender, D. Sturm, S. 

Pleier, H. Cin, E. Pfaff, L. Sieber, A. Wittmann, M. Remke, H. Witt, S. Hutter, T. 

Tzaridis, J. Weischenfeldt, B. Raeder, M. Avci, V. Amstislavskiy, M. Zapatka, U.D. 

Weber, Q. Wang, B. Lasitschka, C.C. Bartholomae, M. Schmidt, C. von Kalle, V. Ast, C. 

Lawerenz, J. Eils, R. Kabbe, V. Benes, P. van Sluis, J. Koster, R. Volckmann, D. Shih,  M.J. Betts, R.B. Russell, S. Coco, G.P. Tonini, U. Schuller, V. Hans, N. Graf, Y.J. Kim, C. 

Monoranu, W. Roggendorf, A. Unterberg, C. Herold‐Mende, T. Milde, A.E. Kulozik, A. 

von Deimling, O. Witt, E. Maass, J. Rossler, M. Ebinger, M.U. Schuhmann, M.C. 

Fruhwald, M. Hasselblatt, N. Jabado, S. Rutkowski, A.O. von Bueren, D. Williamson,  S.C. Clifford, M.G. McCabe, V.P. Collins, S. Wolf, S. Wiemann, H. Lehrach, B. Brors, W. 

Scheurlen, J. Felsberg, G. Reifenberger, P.A. Northcott, M.D. Taylor, M. Meyerson,  S.L. Pomeroy, M.L. Yaspo, J.O. Korbel, A. Korshunov, R. Eils, S.M. Pfister, P. Lichter,  Dissecting the genomic complexity underlying medulloblastoma, Nature 488 (2012)  100‐105 

 

[33] L. Schweigerer, S. Breit, A. Wenzel, K. Tsunamoto, R. Ludwig, M. Schwab, Augmented  MYCN expression advances the malignant phenotype of human neuroblastoma cells: 

evidence for induction of autocrine growth factor activity, Cancer research 50 (1990)  4411‐4416 

 

[34] L. Schweigerer, P. Scheurich, T. Fotsis, Enhanced MYCN oncogene expression in human  neuroblastoma cells results in increased susceptibility to growth inhibition by TNF  alpha, Biochemical and biophysical research communications 170 (1990) 1301‐1307  of N‐myc in human neuroblastoma cells increases expression of alpha‐prothymosin  and ornithine decarboxylase and accelerates progression into S‐phase early after  mitogenic stimulation of quiescent cells, Oncogene 13 (1996) 803‐812 

 

[37] V. Ehemann,  B. Hashemi, A. Lange,  H.F. Otto, Flow cytometric DNA  analysis and  chromosomal aberrations in malignant glioblastomas, Cancer letters 138 (1999) 101‐ Reverse transfection on cell arrays for high content screening microscopy, Nature  protocols 2 (2007) 392‐399 

 

[40] N. Harder, R. Batra, S. Gogolin, N. Diessl, R. Eils, F. Westermann, R. König, K. Rohr, Large‐

Scale  Tracking  for  Cell  Migration  and  Proliferation  Analysis  and  Experimental  Optimization  of  High‐Throughput  Screens,  Proc.  6th  Internat.  Workshop  on  Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB '11) (2011)  

 

85

Holstege,  T.R.  Brummelkamp,  R.  Agami,  H.  Clevers,  Specific  inhibition  of  gene  expression using a stably integrated, inducible small‐interfering‐RNA vector, EMBO  reports 4 (2003) 609‐615 

 

[43] E.A. Afanasyeva, P. Mestdagh, C. Kumps, J. Vandesompele, V. Ehemann, J. Theissen, M. 

Fischer, M. Zapatka, B. Brors, L. Savelyeva, V. Sagulenko, F. Speleman, M. Schwab, F. 

Westermann, MicroRNA miR‐885‐5p targets CDK2 and MCM5, activates p53 and  inhibits proliferation and survival, Cell death and differentiation 18 (2011) 974‐984   

[44] O. Henegariu, P. Bray‐Ward, D.C. Ward, Custom fluorescent‐nucleotide synthesis as an  alternative method for nucleic acid labeling, Nature biotechnology 18 (2000) 345‐348   

[45] L. Savelyeva, E. Sagulenko, J.G. Schmitt, M. Schwab, The neurobeachin gene spans the  common fragile site FRA13A, Human genetics 118 (2006) 551‐558 

 

[46] P. Kett, B. Geiger, V. Ehemann, D. Komitowski, Three‐dimensional analysis of cell  nucleus structures visualized by confocal scanning laser microscopy, J Microsc 167  (1992) 169‐179 

 

[47] A. Oberthuer, F. Berthold, P. Warnat, B. Hero, Y. Kahlert, R. Spitz, K. Ernestus, R. Konig,  S.  Haas,  R.  Eils, M.  Schwab,  B.  Brors,  F.  Westermann,  M.  Fischer,  Customized  oligonucleotide microarray gene expression‐based classification of neuroblastoma  patients outperforms current clinical risk stratification, J Clin Oncol 24 (2006) 5070‐

5078   

[48] W. Huang da, B.T. Sherman, R.A. Lempicki, Systematic and integrative analysis of large  gene lists using DAVID bioinformatics resources, Nature protocols 4 (2009) 44‐57   

[49] K.O. Henrich, M. Fischer, D. Mertens, A. Benner, R. Wiedemeyer, B. Brors, A. Oberthuer,  F. Berthold, J.S. Wei, J. Khan, M. Schwab, F. Westermann, Reduced expression of  CAMTA1 correlates with adverse outcome in neuroblastoma patients, Clin Cancer Res  12 (2006) 131‐138 

 

[50]  T.  Hothorn,  K.  Hornik,  A.  Zeileis,  Unbiased  Recursive  Partitioning:  A  Conditional  Inference Framework, Journal of Computational and Graphical Statistics 15 (2006)  651‐674 

 

[51] D.J. Gordon, B. Resio, D. Pellman, Causes and consequences of aneuploidy in cancer,  Nature reviews. Genetics 13 (2012) 189‐203 

 

[52] F. Westermann, K.O. Henrich, J.S. Wei, W. Lutz, M. Fischer, R. Konig, R. Wiedemeyer, V. 

Ehemann, B. Brors, K. Ernestus, I. Leuschner, A. Benner, J. Khan, M. Schwab, High  Skp2  expression  characterizes  high‐risk  neuroblastomas  independent  of  MYCN  status, Clin Cancer Res 13 (2007) 4695‐4703 

 

[53] J.S. Lanni, T. Jacks, Characterization of the p53‐dependent postmitotic checkpoint  following spindle disruption, Molecular and cellular biology 18 (1998) 1055‐1064   

[54] Z.A. Stewart, D. Mays, J.A. Pietenpol, Defective G1‐S cell cycle checkpoint function  sensitizes cells to microtubule inhibitor‐induced apoptosis, Cancer research 59 (1999)  3831‐3837 

 

[55]  D.A.  Tweddle,  A.J.  Malcolm,  N.  Bown,  A.D.  Pearson,  J.  Lunec,  Evidence  for  the  development of p53 mutations after cytotoxic therapy in a neuroblastoma cell line,  Cancer research 61 (2001) 8‐13 

[57] M.V. Blagosklonny, Mitotic arrest and cell fate: why and how mitotic inhibition of  transcription drives mutually exclusive events, Cell cycle (Georgetown, Tex 6 (2007)  70‐74 

 

[58] W.M. Zhao, G. Fang, Anillin is a substrate of anaphase‐promoting complex/cyclosome  (APC/C) that controls spatial contractility of myosin during late cytokinesis, The  Journal of biological chemistry 280 (2005) 33516‐33524 

 

[59] J.V. Shah, D.W. Cleveland, Waiting for anaphase: Mad2 and the spindle assembly  checkpoint, Cell 103 (2000) 997‐1000 

 

[60] S. Martin‐Lluesma, V.M. Stucke, E.A. Nigg, Role of Hec1 in spindle checkpoint signaling  and kinetochore recruitment of Mad1/Mad2, Science 297 (2002) 2267‐2270 

 

[61] J. Thacker, The RAD51 gene family, genetic instability and cancer, Cancer letters 219  (2005) 125‐135 

 

[62] P. Giannakakou, D.L. Sackett, Y. Ward, K.R. Webster, M.V. Blagosklonny, T. Fojo, p53 is  associated with cellular microtubules and is transported to the nucleus by dynein,  Nature cell biology 2 (2000) 709‐717 

 

[63] W.F. Ooi, A. Re, V. Sidarovich, V. Canella, N. Arseni, V. Adami, G. Guarguaglini, M. 

Giubettini, P. Scaruffi, S. Stigliani, P. Lavia, G.P. Tonini, A. Quattrone, Segmental 

87 Manuskript II

chromosome aberrations converge on overexpression of mitotic spindle regulatory  genes in high‐risk neuroblastoma, Genes, chromosomes & cancer (2012)  

 

[64] A.L. Krasnoselsky, C.C. Whiteford, J.S. Wei, S. Bilke, F. Westermann, Q.R. Chen, J. Khan,  Altered  expression  of  cell  cycle  genes  distinguishes  aggressive  neuroblastoma,  Oncogene 24 (2005) 1533‐1541 

 

[65] A. Menssen, A. Epanchintsev, D. Lodygin, N. Rezaei, P. Jung, B. Verdoodt, J. Diebold, H. 

Hermeking, c‐MYC delays prometaphase by direct  transactivation  of MAD2 and  BubR1: identification of mechanisms underlying c‐MYC‐induced DNA damage and  chromosomal instability, Cell cycle (Georgetown, Tex 6 (2007) 339‐352 

 

[66] G. Fang, H. Yu, M.W. Kirschner, The checkpoint protein MAD2 and the mitotic regulator  CDC20 form a ternary complex with the anaphase‐promoting complex to control  anaphase initiation, Genes & development 12 (1998) 1871‐1883 

 

[67] S.L. Thompson, D.A. Compton, Proliferation of aneuploid human cells is limited by a  p53‐dependent mechanism, The Journal of cell biology 188 (2010) 369‐381 

 

[68] J.A. Barboza, G. Liu, Z. Ju, A.K. El‐Naggar, G. Lozano, p21 delays tumor onset by  preservation of chromosomal stability,  Proceedings of the  National Academy of  Sciences of the United States of America 103 (2006) 19842‐19847 

 

[69] D.A. Tweddle, A.D. Pearson, M. Haber, M.D. Norris, C. Xue, C. Flemming, J. Lunec, The  p53 pathway and its inactivation in neuroblastoma, Cancer letters 197 (2003) 93‐98   

[70]  G.M.  Brodeur,  A.A.  Green,  F.A.  Hayes,  K.J.  Williams,  D.L.  Williams,  A.A.  Tsiatis,  Cytogenetic features of human neuroblastomas and cell lines, Cancer research 41  (1981) 4678‐4686 

 

[71] R.C. Seeger, S.A. Rayner, A. Banerjee, H. Chung, W.E. Laug, H.B. Neustein, W.F. Benedict,  Morphology, growth,  chromosomal  pattern and fibrinolytic activity  of two new  human neuroblastoma cell lines, Cancer research 37 (1977) 1364‐1371 

 

[72] A. Valent, J. Benard, B. Clausse, M. Barrois, D. Valteau‐Couanet, M.J. Terrier‐Lacombe, B. 

Spengler, A. Bernheim, In vivo elimination of acentric double minutes containing  amplified  MYCN  from  neuroblastoma  tumor  cells  through  the  formation  of  micronuclei, The American journal of pathology 158 (2001) 1579‐1584 

Supplementary information see appendix of the thesis.