A Ampère
AAA triple A domain
AAC ADP/ ATP carrier
ADP adenosine diphosphate
Amp ampicillin
APS ammonium peroxodisulfate
ATP adenosine triphosphate
ATPase adenosine triphosphatase
BSA bovine serum albumin
C- carboxy-
CAT carboxy atractyloside
CBB coomassie brilliant blue
CCCP carbonyl cyanide m-chlorophenylhydrazone
cDNA complementary DNA
c- centi-
Cyb2 Cytochrome b2
DHFR dihydrofolate reductase
DMSO dimethylsulfoxid
DNA desoxyribonucleic acid
DTT dithiotreitol
Δ delta
dNTP deoxyribonucleoside triphosphate
ECL enhanced chemiluminescence
E. coli Escherichia coli
EDTA ethylendiamine tetraacetate
g gram
g gravity
gDNA genomic DNA
Hepes N-2 hydroxyl piperazine-N’-2-ethane sulphonic acid
His6 hexahistidine polypeptide
ABBREVIATIONS
Hsp heat shock protein
H. sapiens Homo sapiens
IgG immunoglobulin G
IM inner membrane
IMP inner membrane peptidase
IMS intermembrane space
IPTG isopropyl-β,D-thiogalactopyranoside
kDa kilo Dalton
kg kilogram
l liter
LB Luria Bertani
LysC endoprotease hydrolyzing at Lys-C-terminus
m meter
m- milli-
MBP maltose-binding protein
min minute
MPP mitochondrial processing peptidase
MS mass spectrometry
MTS matrix targeting signal
MTX methotrexate
M. musculus Mus musculus
myc- polypeptide derived from c-myc gene product
µ- micro-
N- amino-
NADH nicotine amide adenine dinucleotide
NADPH nicotine amide adenine dinucleotide phosphate Ni-NTA nickel-nitrilo triacetic acid
ODx optical density at x nm
OM outer membrane
OXA oxidase assembly protein
PAGE polyacrylamide gel electrophoresis
PCR polymerase chain reaction
PEG polyethylene glycol
PI preimmune serum
PIR protease inhibitor reagent (Roche)
PK proteinase K
PMSF phenylmethylsulfonylfluoride
RNA ribonucleic acid
RNasin ribonuclease inhibitor
rpm rounds per minute
RT room temperature
S. cerevisiae Saccharomyces cerevisiae
SDS sodium dodecyl sulfate
SILAC stable isotope labeling of amino acids in cell culture
TBS TRIS-buffered saline
TCA trichloroacetic acid
TEMED N.N.N’,N’-tetramethylene diamine
TIM translocase of the inner mitochondrial membrane TOM translocase of the outer mitochondrial membrane
TRIS tris-(hydroxymethyl)-aminomethane
Tx-100 TritonX-100
U Unit(s)
V Volt
v/v volume per volume
w/V weight per volume
WT wild-type
Xh hydrophobic
Δψ membrane potential
Publications resulting from this thesis
Schreiner, B., Westerburg, H., Forne, I., Imhof, A., Neupert, W., and Mokranjac, D.
(2012). Role of the AAA protease Yme1 in folding of proteins in the intermembrane space of mitochondria. Mol Biol Cell 23, 4335-4346.
Möglichkeit für mich, in Ihrem Labor meine Doktorarbeit durchführen zu können. Vielen Dank für Ihren Glauben an mich und daran, dass ich es „noch besser“ kann. So konnte ich mich weiterentwickeln, wachsen und wichtige Erfahrungen für die Zukunft sammeln.
Ich möchte mich bei Prof. Soll bedanken für seine Bereitschaft, mein offizieller Doktorvater zu sein. Vielen Dank, dass alle bürokratischen Schritte so unkompliziert verlaufen konnten.
Ich möchte mich bedanken bei Prof. Vothknecht. Herzlichen Dank, dass Sie sich bereit erklärt haben, das Zweitgutachten meiner Doktorarbeit zu übernehmen und damit auch Mitglied meines Rigorosums zu sein. Ich möchte mich bei Frau Prof. Conradt und Prof.
Felmy für ihr Interesse an meinem Projekt und die Teilnahme an meinem Rigorosum bedanken. Ich möchte mich bei Prof. Nickelsen und Prof. Schleicher für die Teilnahme und unkomplizierte Durchfürhung des Umlaufs danken.
Many thanks to Prof. Ladurner for giving me the opportunity to continue working in the institute that got so nicely intercultural and interdisciplinary creating a highly motivating working atmosphere.
In particular, I wish to thank Dejana for being my patient and motivating group leader through “good and bad” times, always encouraging me in the right moment, teaching me that patience is gold in science and that being deliberate is more important than being fast. Thank you for sharing your enormous scientific knowledge with me and furthermore for taking care of my non-scientific gaps of knowledge (Who is Darth Vader?)
Ich möchte mich beim Elitenetzwerk Bayern bedanken für die Möglichkeit, am Graduiertenkolleg ‘Protein Dynamics in Health and Disease’ teilnehmen zu können. Das Programm war für meine wissenschaftliche Entwicklung von großer Bedeutung.
Vielen Dank liebe Christine für deine stetigen Bemühungen und deine Unterstützung in allen bürokratischen Angelegenheiten. Ich war immer froh, eine Anlaufstelle für all meine Fragen und Probleme zu haben. Danke, dass du dich so für mich eingesetzt hast.
Danke dir Kai für deine Unterstützung in wissenschaftlichen Fragen, für dein großes Engagement beim ENB und viele Runden im Park. Thank you Corey for your time and patience in helping me to make my rather poetic and literary writing a bit more scientific.
Hope, you didn’t suffer too much! Thank you, Francois for your endless patience in helping me with all kinds of computer problems, your advice in professional issues and lots of fun in the lab. Karin und Petra, danke euch Mädels für viele schöne, lustige Stunden im Labor und jede Menge Unterstützung und Motivation wenn es mal wieder nicht so lief. Liebe Chrissy, wir haben uns erst spät besser kennengelernt und trotzdem hab ich das Gefühl, dass wir uns schon ewig kennen. Danke für so viele gute Gespräche, nachdenkliche und lustige Stunden, für deine Gesellschaft bei Zumba, Rock im Park und sonstigen Aktionen. Ich hoffe sehr, dass wir in Kontakt bleiben. Liebe Simone, vielen Dank für die schöne Zeit hier in München. Wir hatten so viele gute Gespräche über „Gott und die Welt“. Ich wünsch mir, dass wir uns nicht aus den Augen verlieren trotz großer Entfernung.
Vielen Dank, liebe Christiane für deine Freundschaft, die ein so wichtiger Bestandteil für meine “Münchner Zeit” war, sowohl beruflich als auch privat. Danke für viele gute Gespräche im Auto bei laufendem Motor, bei unserem Da Ugo oder beim joggen... Ich werd’s sehr vermissen und hoffe, wir bleiben in Kontakt. Danke dir Peter für nette „Werkstattgespräche“ und immer aufbauende Worte, für deine Hilfsbereitschaft und für unzählige Fahrrad-Notoperationen.
Liebe Heike, dir auch ein ganz herzliches Dankeschön. Mit viel Zeit und Geduld hast du mich ins Projekt eingearbeitet. Und es motiviert so sehr, wenn man auch für “kleine