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This specific protein domain is specialized in the recognition of proline-rich sequences in a PP-II-helix conformation

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Academic year: 2021

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KURZZUSAMMENFASSUNG

Aufgrund ihrer unmittelbaren Verknüpfung zur Migration von Krebszellen stellt die EVH1- Domäne ein interessantes Target für die Entwicklung neuartiger Krebstherapien dar. Diese Proteindomäne bindet spezifisch an prolinreiche Sequenzen von Partnerproteinen, in einer PPII-Helix-Konformation. Die vorliegende Arbeit beschreibt die stereoselektive Synthese Prolinabgeleiteter Module (ProMs), die in einer solchen PPII-Helix-Konformation fixiert sind.

Neben der Bereitstellung bereits bekannter tricyclischer Diprolinanaloga konnten auf Basis von computergestützten Modellierungen neuartige konformationell definierte ProM-Bausteine (DH-ProM-2 und ProM-13) entworfen und anschließend synthetisiert werden. Des Weiteren wurde eine effiziente und im Multi-Gramm Maßstab durchführbare Kupplungsstrategie zur Verknüpfung dieser Scaffolds in der Flüssigphase entwickelt. Diese ermöglichte nicht nur einen optimierten Zugang zu einem zuvor etablierten ProM-basierten EVH1-Inhibitor, sondern erlaubte zudem die Bereitstellung zweier neuer ProM-Liganden peptidischer Natur. Im Rahmen von Bindungsstudien, durchgeführt am Leibniz-Institut für Molekulare Pharmakologie (FMP) in Berlin, konnte die biologische Wirkung eines ProM-13-basierten Liganden eindrucksvoll unter Beweis gestellt werden. Letzterer erreichte für die anvisierte Proteindomäne eine Bindungsaffinität im nanomolaren Bereich und stellt den bis dato stärksten und selektivsten EVH1-Inhibitor dar.

ABSTRACT

Due to its major complicity in the migration of cancer cells, the EVH1-domain represents an interesting target for the anti-metastatic drug development. This specific protein domain is specialized in the recognition of proline-rich sequences in a PP-II-helix conformation. In this context, the present work describes the stereoselective synthesis of proline-derived modules (ProMs) rigidified in such a PPII-helix conformation. In addition to the preparation of already known tricyclic diproline analogues in substancial quantities, novel conformationally defined ProM building blocks (DH-ProM-2 and ProM-13) could be designed in silico and were subsequently synthesized. Furthermore, an efficient and multi-gram scale coupling strategy was developed to combine these scaffolds in the liquid phase. This method allowed an optimized access to a previously established ProM-based EVH1 inhibitor and the synthesis of two new ProM containing ligands of peptidic nature. Binding studies conducted at the Leibniz Institute for Molecular Pharmacology (FMP) in Berlin exposed the ProM-13-based ligand as the strongest and most selective EVH1-inhibitor to date, achieving for the first time a binding affinity for the targeted protein domain in the nanomolar range.

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