6. APPENDIX 1 Instruments
6.8 Software
Table 6-28: Softwares which were used for analysis and quantitation
Software Used for Version Company
NIS Elements Images 4.10.01 Nikon
CFX Manager qPCR 3.1 Bio-Rad
Image Studio Western Blot analysis 3.1 LI-COR
GraphPad Prism Graphs; statistical analysis 5.01 Prism
cellZscope TEER measurement 2.2.2 NanoAnalytics
FlowJo FACS analysis 8.8.7 FlowJo, LLC
ImageJ Stroke area 1.48 -
DANKSAGUNG
Da eine wissenschaftliche Arbeit nie von einer Person alleine ausgeführt wird, möchte ich an dieser Stelle die Gelegenheit nutzen, mich bei denjenigen zu bedanken, die zu dieser Dissertation beigetragen haben.
Zunächst bedanke ich mich beim Direktor des Edinger Instituts, Prof. Dr. Karl H. Plate, der mir die Möglichkeit gegeben hat an diesem spannenden Thema arbeiten zu können und mich bei der Ausführung des Manuskripts für eine Fachzeitschrift und für die Dissertation gefördert und unterstützt hat. Konstruktive und zielführende Diskussionen, zusammen mit meiner Betreuerin Dr. med. habil. Yvonne Reiss, haben zur erfolgreichen Ausarbeitung meiner Arbeit geführt.
Außerdem gilt ein großer Dank an Frau Prof. Dr. Anna-Starzinski-Powitz, die als interne Fach-Betreuerin der Goethe-Universität Frankfurt für die Begutachtung meiner Arbeit fungiert, obwohl sie als Prodekanin viel beschäftigt ist.
Bei meiner Gruppenleiterin Dr. med. habil. Yvonne Reiss möchte ich mich besonders für die freie Entfaltung innerhalb ihrer Arbeitsgruppe bedanken, die mich stets bei Planungen und Durchführungen von Experimenten unterstützt hat und Kollaborationen zu anderen Arbeitsgruppen vermittelte. Dadurch konnte ich an einem internationalen Meeting in den USA teilnehmen, das mir neue Blickpunkte für meine Arbeit aufzeigte.
Zu den Kollaborationspartnern gehört Dr. Kavi Devraj, dem ich verdanke, dass mit seinem wissenschaftlichen und thematischen Wissen viele Gedankengänge in die Arbeit eingeflossen sind.
Andere Kollaborationspartner trugen zur Ausarbeitung teils komplexer Versuche bei, bei denen ich mich recht herzlich bedanken möchte. Dazu gehören: Prof. Dr. Michel Mittelbronn für die Analyse der humanen Schlaganfall-Proben, Prof. Dr. Christian Förch für das zur Verfügung stellen von Blutserum Proben von Schlaganfall-Patienten, Julia Starke und Dr. Heike Beck für die Durchführung des permanenten Schlaganfall-Modells, wobei Julia Starke auch zur Auswertung der Daten beitrug, Dr. Maiko Yamaji für die Ausführung von Western Blots und den Austausch wissenschaftlicher Expertise, Jadranka Macas für die Erstellung und Erklärungen der elektronen-mikroskopischen Aufnahmen, Dr. Mariangela DiTacchio für FACS Analysen, sowie Rajkumar Vutukuri und
PD Dr. Waltraud Pfeilschifter für die Durchführung und Expertise des transienten Schlaganfalls.
Weiterhin möchte ich mich bei meinen Arbeitskollegen für die gute Zusammenarbeit und freundliche, sowie angenehme Atmosphäre während der Arbeit bedanken. Kathleen Sommer, unsere technische Assistentin, hat mich in den Anfängen meiner Doktorarbeit sehr gut unterstützt und darüber hinaus bei vielen Experimenten Hilfestellungen geleistet. Bei Stefanie Jesgarek möchte ich mich besonders für die Betreuung der Maustierlisten, sowie für die Durchführung von Genotypisierungen und immunhistochemischen Färbungen bedanken. Stephanie Gelhardt danke ich für die bedeutende Betreuung der Mauszucht in der Zentralen Forschungseinheit, Frankfurt.
Burak Yalcin, Nicole Ziegler, Jenny Zinke und Sonja Thom standen mir bei zahlreichen Fragen zur Seite.
Ohne einen starken Rückhalt und Unterstützung meiner Familie wäre die Ausarbeitung dieser Arbeit gar nicht möglich gewesen. Besonderen Dank und Anerkennung möchte ich daher meinen Eltern, meinem Bruder und meinem geliebten Freund widmen. Sie haben dieses Werk in allen Phasen mit jeglicher Unterstützung bedacht.
ERKLÄRUNG
Ich erkläre hiermit, dass ich mich bisher keiner Doktorprüfung im Mathematisch-Naturwissenschaftlichen Bereich unterzogen habe.
Frankfurt am Main, den …………... ………
(Unterschrift)
VERSICHERUNG
Ich erkläre hiermit, dass ich die vorgelegte Dissertation über
„Angiopoietin-2 induced blood-brain barrier compromise and increased stroke is rescued by targeting vascular endothelial protein tyrosine phosphatase”
selbständig angefertigt und mich anderer Hilfsmittel als der in ihr angegebenen nicht bedient habe, insbesondere, dass alle Entlehnungen aus anderen Schriften mit Angabe der betreffenden Schrift gekennzeichnet sind.
Ich versichere, die Grundsätze der guten wissenschaftlichen Praxis beachtet, und nicht die Hilfe einer kommerziellen Promotionsvermittlung in Anspruch genommen zu haben.
Frankfurt am Main, den ……… ………
(Unterschrift)
CURRICULUM VITAE
PERSONAL DETAILS
Name: Stefanie Gurnik
Date and place of birth: 19th June 1987 in Nürnberg, Germany Nationality: German
Present position: PhD student
Present address: Institute of Neurology / Edinger Institute Neuroscience Center, Building 89 Goethe University, School of Medicine Heinrich-Hoffmann-Str. 7
60528 Frankfurt, Germany
Telephone No: +49 (0) 69 6301 84161 Fax No: +49 (0) 69 6301 84149
E-Mail: stefanie.gurnik@kgu.de
EDUCATION
12/2011 - 2015 (expected) Postgraduate Study in Biology
Goethe University, Frankfurt am Main, Germany 10/2008 – 09/2011 Degree in Biology – Diploma in molecular biology
Graduation grade: 1.2 Study of Biology
Goethe University, Frankfurt am Main, Germany Final examination: forensic biology, cell biology, genetics
10/2006 – 07/2008 Pre-Diploma
Graduation grade: 2.2 Study of Biology
Goethe University, Frankfurt am Main, Germany
07/2006 Abitur / A-Level
Graduation grade: 2.3
Oswald-von-Nell-Breuning-Schule, Rödermark, Germany
PROFESSIONAL EXPERIENCE
12/2011 - 2015 (expected) PhD Thesis
Institute for Neurology (Edinger Institute)
Johann Wolfgang Goethe University Medical School Frankfurt am Main, Germany.
Supervisor: Prof. Dr. Karl-Heinz Plate / Dr. med. habil.
Yvonne Reiss, Prof. Dr. Anna Starzinski-Powitz Topic:
“Angiopoietin-2 induced blood-brain barrier
compromise and increased stroke size is rescued by targeting vascular endothelial protein tyrosine
phosphatase”
01/2011 - 09/2011 Diploma Thesis
Chemotherapeutic Research Institute Georg-Speyer-House, Institute for Tumor Biology and Experimental Therapy
Frankfurt am Main, Germany
Supervisor: PD Dr. Martin Zörnig, Prof. Dr. Enrico Schleiff
Topic:
“Analysis of the role of the anti-apoptotic protein Aven in DNA damage response “
01/2010 - 02/2010 Genetics - Group of Prof. Dr. Anna Starzinski-Powitz,
Institute for Cellular Biology and Genetics, Frankfurt am Main, Germany
09/2009 - 10/2010 Forensic Biology - Group of Dr. Richard Zehner, Center of Forensic Medicine, Entomology, Frankfurt am Main, Germany
07/2009 - 08/2009 Forensic Biology - Group of Dr. Esther Reuss, Center of Forensic Medicine, DNA analysis, Frankfurt am Main, Germany
04/2009 - 05/2009 Cell Biology - Group of Prof. Dr. Enrico Schleiff Institute of Molecular cell biology of plants Frankfurt am Main, Germany